Tenk deg at virkeligheten er en drøm - denne tanken forfølger Thomas Anderson (Keanu Reeves). Thomas lever et dobbeltliv. Om dagen er han ansatt i et stort datafirma, om natten er han hackeren Neo, en langer av virtuelle fantasier. Etter en arbeidsøkt i den digitale gråsonen våkner Neo av at noen kontakter ham via dataskjermen. Like etter blir Neo arrestert. Agent Smith ser på den unge dataeksperten som en trussel, og Neo blir enda mer forvirret. Først når han treffer Morpheus (Laurence Fishburne), begynner bildet å bli skapt. Morpheus forklarer Neo hvilken rolle han må spille for å bekjempe "Matrix" - et altomfattende fenomen som angår hele verdens befolkning. Sannheten er mer utspekulert enn noen kan fatte.

Når New York-politiet etter et anonymt tips arresterer fem kjente kriminelle, mistenkt for å stå bak ranet av en pengetransport, setter de i gang en voldsspiral som ender i en massakre på San Pedro havnen i California. Fasit er 27 døde og 91 millioner dollar forsvunnet. Bare to mennesker overlever. Mange av likene er ugjenkjennelige og Keaton, en av de fem kriminelle, er blant de fem savnede. Sammen med sine etterforskere starter spesialagent Kujan sine avhør av de overlevende, og sakte men sikkert kommer sannheten frem. Men to spørsmål gjenstår: Er Keaton virkelig død? Og hvem og hvor er den mystiske mafioso Keyser Söse?

I nær fremtid har kriminaliteten økt med 400 % og hele Manhattan har blitt omgjort til en fengselsøy omgitt av skyhøye vegger. Regelen er enkel: den som er låst inne her, blir aldri sluppet ut igjen. Men etter at den amerikanske presidenten krasjlandet på øya, måtte noen inn i det dødelige området for å finne ham. Oppdraget går til en ny fange, tidligere soldat Snake Plissken. Hvis han lykkes, blir han belønnet med sin frihet. Hvis han mislykkes, vil den eksplosive ladningen implantert i kroppen hans bli utløst. Han har nøyaktig 24 timer...

Neo og lederne av den menneskelige motstanden oppdager at Sentinels holder på å grave vei mot Sion. De beregner at de kanskje bare har 72 timer til angrepet må ta plass, og Neo må derfor returnere tilbake til the Matrix og finne nøkkellageren slik at de kan få tilgang til hovedmaskinen for å sikre menneskelig overlevelse.

Michael Conroy er historieprofessor,han har nettopp blitt enkemann og bor sammen med sin ti år gamle sønn i Washington DC. Hans avdøde kone var FBI- agent og døde under tjeneste. Både far og sønn sørger dypt, men en dag flytter familien Hunt inn i nabohuset og både far og sønn knytter nye vennskapsbånd med de nyinnflyttede. Etter et par underlige oppdagelser blir Michael mistenksom på familien Hunts fortid og han begynner og finne ut av ting i fortiden som absolutt ikke tåler dagens lys.....

Neo. Trinity. Morpheus. De og andre helter står på randen til seier eller tilintetgjørelse i den episke krigen mot maskinene i det overveldende siste kapittelet av Matrix-trilogien. For Neo betyr det å reise dit intet menneske har våget seg – inn i hjertet av Machine City og inn i en verdensomveltende konfrontasjon med det mange ganger sterkere forræderprogrammet Smith.