Ιαπωνία, 19ος αιώνας. Ο Zatoichi είναι ένας τυφλός περιηγητής, που κερδίζει τα προς το ζην παίζοντας τυχερά παιχνίδια και κάνοντας μασάζ. Πίσω, όμως, από την ταπεινή του εμφάνιση κρύβεται ένας απόλυτος μετρ του ξίφους με το χάρισμα χτυπημάτων απίστευτης ταχύτητας και σημαδιού που κόβει την ανάσα! Περιπλανώμενος θα ανακαλύψει ένα απομονωμένο χωριό, στο έλεος της συμμορίας του Γκίνζο. Στο δρόμο του θα βρεθεί ένας πιστός φίλος αλλά και δύο γκέισες που θέλουν να εκδικηθούν για το φόνο του πατέρα τους από αδίστακτους κακοποιούς.
1988, η Νέα Υόρκη έχει μετατραπεί σε μια τεράστια φυλακή, όπου οι εγκληματίες αφήνονται να επιβιώσουν με όποιο τρόπο μπορούν. 1997, ο πρόεδρος των ΗΠΑ, μετά από μια αεροπειρατεία στο προεδρικό αεροσκάφος, καταλήγει αιχμάλωτος στην Νέα Υόρκη. Σε έναν νεοεισαχθέντα κατάδικο, προσφέρεται αμνηστία με την προϋπόθεση να τον σώσει εντός 24ώρου.
O Νίο, ο Μορφέας, και η Τρίνιτυ μας «ξυπνάνε» μέσα στον αφόρητα πραγματικό και σκοτεινό κόσμο του Μάτριξ. Αποστολή του Νίο είναι, να σώσει σε 72 μόλις ώρες την Ζάιον, την τελευταία ελεύθερη πόλη, από ένα στρατό 250.000 φονικών μηχανών που απειλεί να την καταστρέψει. Σε αντίθετη περίπτωση το ανθρώπινο γένος θα εξαφανιστεί από προσώπου Γης. Οι κάτοικοί της ωστόσο, ενθαρρυμένοι από την πεποίθηση του Μορφέα ότι η προφητεία θα εκπληρωθεί και ο πόλεμος με τις μηχανές θα λάβει τέλος, χάρη στον «εκλεκτό» που είναι ο Νίο, εναποθέτουν όλες τις ελπίδες τους σ΄ αυτόν. Ο Νίο όμως, βασανίζεται από τρομακτικούς εφιάλτες που αφορούν τη ζωή της αγαπημένης του Τρίνιτυ.
Κατά τη διάρκεια της Κινέζικης δυναστείας των Τανγκ, ο αυτοκράτορας έχει πάρει ως σύζυγο την πριγκίπισσα μιας γειτονικής επαρχίας. Του έδωσε δύο γιούς και μεγάλωσε τον μεγαλύτερο γιο που είχε ήδη. Τώρα ο έλεγχος που ασκεί στο βασίλειό του είναι ολοκληρωτικός, συμπεριλαμβανομένης και της βασιλικής οικογένειας.
Ο Νίο έχει παγιδευτεί στον «Σιδηροδρομικό Σταθμό», μια διάσταση κάπου ανάμεσα στο Μάτριξ και τον πραγματικό κόσμο. Ο Μορφέας, η Τρίνιτι και ο Σέραφ οργανώνουν την επιχείρηση διάσωσής του ζητώντας τη βοήθεια του Μεροβίγγιου. Εντωμεταξύ οι στρατιές των Μηχανών κατευθύνονται προς την Ζάιον, το τελευταίο οχυρό της ανθρώπινης αντίστασης ενάντια στην κυριαρχία τους. Όμως δεν έχουν ακόμη αντιληφθεί πως κάποιος έχει αποκτήσει τον έλεγχο του Μάτριξ με σκοπό να καταστρέψει τα πάντα: ο κύριος Σμιθ! Ενώ η Ζάιον αντιστέκεται σθεναρά στις καταιγιστικές επιθέσεις των Μηχανών, ο Νίο καταδύεται στα άδυτα του Μάτριξ σε μια ύστατη προσπάθεια να έρθει αντιμέτωπος με τον Σμιθ και να ματαιώσει τα σχέδιά του.
Όταν ποσότητες ραδιενεργών αποβλήτων έρχονται σε επαφή με τέσσερα χελωνάκια κι έναν αρουραίο στους σκοτεινούς υπονόμους της Νέας Υόρκης, η χημική αντίδραση που δημιουργείται προκαλεί κάτι αδιανόητο. Ο αρουραίος είναι πλέον ο σοφός δάσκαλος Σπλίντερ και οι χελώνες… χελωνονιντζάκια! Ο Ραφαέλ, ο Μικαλάντζελο, ο Ντονατέλο κι ο Λεονάρντο είναι άσοι στο να τρώνε πίτσα και να καταπολεμούν το έγκλημα με τις γνώσεις τους πάνω στις πολεμικές τέχνες. Ο εχθρός ονομάζεται Σρέντερ και η επιθυμία του να κατακτήσει τον κόσμο μπορεί να βρει κόντρα μονάχα από τους τέσσερις ήρωες.
Ένας Αμερικανός έφηβος, που έχει μανία με τις πολεμικές τέχνες και τον ασιατικό πολιτισμό, κάνει μια περίεργη ανακάλυψη σε ένα μαγαζάκι της Chinatown: ανάμεσα σε πολλά άλλα παλιά αντικείμενα βρίσκει την θρυλική ράβδο του Μοnkey King. Με την πολύτιμη ράβδο στο χέρι, ο νεαρός ταξιδεύει πίσω στην αρχαία Κίνα, παρέα με μαχητές πολεμικών τεχνών σε μία επικίνδυνη αποστολή για την απελευθέρωση του αιχμαλώτου Monkey King.
Είναι το όνειρο κάθε γυναίκας κι ο εφιάλτης μιας συγκεκριμένης. Ένας πληροφοριοδότης του FBI έχει κρατήσει την νέα του ταυτότητα κρυφή για 15 χρόνια, τώρα όμως μια παλιά του αγάπη τον αναγνώρισε και οι κακοί επιστρέφουν για εκδίκηση.
Οι Χελώνες και ο Σρέντερ μάχονται για άλλη μια φορά, αυτή τη φορά για το τελευταίο δοχείο της λάσπης που δημιούργησε τις Χελώνες, το οποίο ο Σρέντερ θέλει να δημιουργήσει έναν στρατό νέων μεταλλαγμένων.
Μια παρέα φοιτητών που κατά την εκδρομή τους στην ύπαιθρο στο πλαίσιομια φωτογράφισης πέφτουν θύματα μεταλλαγμένων και παραμορφωμένωνμανιακών που διψούν για αίμα. Ένας όμως από την παρέα που δεναιχμαλωτίζεται από τους μανιακούς σχεδιάζει να εκδικηθεί και να σώσειτην κοπέλα του από τα νύχια των μεταλλαγμένων.