Tenk deg at virkeligheten er en drøm - denne tanken forfølger Thomas Anderson (Keanu Reeves). Thomas lever et dobbeltliv. Om dagen er han ansatt i et stort datafirma, om natten er han hackeren Neo, en langer av virtuelle fantasier. Etter en arbeidsøkt i den digitale gråsonen våkner Neo av at noen kontakter ham via dataskjermen. Like etter blir Neo arrestert. Agent Smith ser på den unge dataeksperten som en trussel, og Neo blir enda mer forvirret. Først når han treffer Morpheus (Laurence Fishburne), begynner bildet å bli skapt. Morpheus forklarer Neo hvilken rolle han må spille for å bekjempe "Matrix" - et altomfattende fenomen som angår hele verdens befolkning. Sannheten er mer utspekulert enn noen kan fatte.
Andre del av trilogien begynner når Doc, Marty og Jennifer tar tidsmaskinen til år 2015 for å ordne opp i McFly-familiens fremtid. Men Biff Tannen stjeler maskinen og gir sitt yngre jeg en bok som inneholder 50 år av sportsstatistikker - noe den unge Biff bruker til sin, men ingen andres, fordel. For å forandre på historien må Marty og Doc reise tilbake til 1955 og hente boka.
Sarah Connor er en helt vanlig jente. Hun arbeider som servitør på en cafè og tror at livet er ganske vanlig - helt til hun møter Kyle Reese. Han påstår at han er fra fremtiden, og at han forsøker å redde livet hennes fra en fryktelig drapsmaskin som også er sendt tilbare fram fremtiden for å drepe henne. Til å begynne med tror ikke Sarah på den forvirrede mannen, men så snart den grusomme drapsmaskinen åpenbarer seg - forandrer dette seg raskt. Og Sarah må begynne sin kamp for å overleve.
Elliott finner E.T., som er en vesen fra en annen planet, i en hytte på baksiden av huset der han bor. Elliott vil beholde E.T. og forstår att han må gjemme ham for andre. Så smått blir Elliott, hans søsken og noen av naboskapets barn venn med vesenet, som også liker dem. Men på tross av vennskapet lengter E.T. hjem og nå må Elliott hjelpe ham å komme i kontakt med hans hjemmeplanet. Dessuten er vitenskapsmenn og regjeringen på sporet E.T., og barna må anvende all sin oppfinnsomhet før å holde dem borte fra E.T., den utenomjordiske skapningen.
I siste del av trilogien sendes Marty McFly på en redningsaksjon til år 1885, hvor han i kjølvannet av konflikter med Tannen-klanen må redde Doc Brown fra døden. Men det er flere grunner til at det blir vrient å reise tilbake til fremtiden: lite bensin til tidsmaskinen, en bande pistolmenn og en lærerinne med varme følelser for Doc.
Kaptein Jean-Luc Picard (Patrick Stewart) og Next Generation-mannskapet legger ut på sitt mest spennende eventyr til nå i en science fiction-historie som er i en klasse for seg. De kaller seg Borg - en rase som er halvt roboter og halvt humanoider og bare ett eneste mål: å overvinne alle raser og innlemme dem i sin egen rase. Ledet av sin forførende og sadistiske dronning (Alice Krige), er Borg-rasen på vei mot jorden med utspekulert plan for å endre historien. Picards forrige møte med Borg kostet ham nesten livet. Nå vil han ha hevn. Men hvor langt er han villig til å gå?
Neo og lederne av den menneskelige motstanden oppdager at Sentinels holder på å grave vei mot Sion. De beregner at de kanskje bare har 72 timer til angrepet må ta plass, og Neo må derfor returnere tilbake til the Matrix og finne nøkkellageren slik at de kan få tilgang til hovedmaskinen for å sikre menneskelig overlevelse.
Meteoritter med fremmede vesener slår plutselig ned på jorden. Trusselen fra disse naboene i verdensrommet blir etterhvert påtrengende, og menneskeheten mobiliserer all sin kraft mot den nye fienden. Med stolte propaganda-filmer verver hæren unge rekrutter direkte fra college, der elevene har benyttet biologitimene til å studere fienden. Johnny Rico og venninnen Carmen lar seg verve til den føderale arméen. Begge er lykkelig uvitende om hva som venter. De blir sendt ut som barske soldater, men møter et overveldende og ukjent helvete... på planeten til de fremmede vesenene.
Dag 1 kommer de - Dag 2 angriper de - Dag 3 er dagen vi slår tilbake. Jorden blir invadert av vesener fra verdensrommet. De ødelegger flere av jordens storbyer for å markere at dette er alvor. Trusler om ødeleggelse får menneskene til å glemme politikk og fordommer og de står sammen for å møte de fremmede.
Neo. Trinity. Morpheus. De og andre helter står på randen til seier eller tilintetgjørelse i den episke krigen mot maskinene i det overveldende siste kapittelet av Matrix-trilogien. For Neo betyr det å reise dit intet menneske har våget seg – inn i hjertet av Machine City og inn i en verdensomveltende konfrontasjon med det mange ganger sterkere forræderprogrammet Smith.
Fra skapelsen av føderasjonen har den viktigste regelen alltid vært helt klar: Ingen Starfleet ekspedisjon får gripe inn i den naturlige utviklingen til andre samfunn. Men nå får Picard ordre som undergraver dette påbudet. Dersom han adlyder, vil 600 fredelige innbyggere på Ba'ku bli tvangsflyttet fra sin fantastiske verden, tilsynelatende for å sikre et bedre liv for millioner som vil nyte godt av Ba'kus ungdomskilde-lignende kraft. Dersom han nekter risikerer han sitt Starship, sin karriere, sitt liv. Men for Picard er det bare én utvei. Han må sloss mot Starfleet... og lede opprøret for å bevare Paradiset.
Kaptein Picard og mannskapet på U.S.S. Enterprise-E konfronteres med en Picard-kloning ved navn Shinzon som hersker over planeten Remus. Shinzon er døende og trenger Picards genmateriale for å overleve, men forsøket hans på å bortføre Picard slår feil og baner vei for et storstilt slag om kontroll over universet. Mannskapet tar opp kampen. Flere kommer til å dø. Men Enterprise-ånden lever videre, for alltid.
En vulcansk desertør med en forbløffende hemmelighet kaprer Enterprise for å lete etter en myteomspunnet planet. Kirk og hans mannskap drar ut for å stoppe en gal mann i et eventyr som tar dem med til universets sentrum og til det som kanskje er et møte med Gud. Mens mannskapet er tatt som gisler av vulcaneren, må kapteinen sette sin lit til en usannsynlig allianse for å redde galaksen.