SIMON OG EIKETRÆRNE bygger på Marianne Fredrikssons mest bejublede og elskede roman av samme navn. Den er en internasjonal bestselger, og nå kommer endelig filmen, den første filmatiseringen av bøkene hennes. Den handler om Simon, som vokser opp i en arbeiderfamilie i utkanten av Göteborg under annen verdenskrig. Til tross for en oppvekst full av kjærlighet føler han seg annerledes og utenfor. Simon er begavet og mot sine foreldres vilje søker han seg til byens høyskole. Der treffer han Isak, sønn av en formuende jødisk bokhandler som flyttet fra forfølgelsene i Tyskland. De to guttene og deres familiers liv veves sammen samtidig som krigen raser i Europa. Ved krigens slutt begynner Simon å skjønne at det finnes hemmeligheter i familien - hemmeligheter som tar ham ut i Europa og som kommer til å forandre hans liv for bestandig.

Det er november 1942 i Warsawa, Polen. Rabbiner Adam Heller og hans datter Rachel gjemmer seg for nazistene, og kan ikke annet enn å bivåne deres venner og naboer bli utmattede av sult, sykdom og redsel. Gjennom det hele beholder de sin tro. I all elendigheten kommer en spire av glede, når Hellers sønn Paul kommer hjem, etter tre år i arbeidsleir og flere måneder i dekning i skogen. Paul har fysiske arr og er nesten ikke til å kjenne igjen, samtidig som han er fylt med et altoppslukende hat. En ung tysk sersjant henter Rachel til et forhør hvor hun blir mishandlet og voldtatt av en høyere offiser. Sersjanten får dårlig samvittighet og bestemmer seg for å hjelpe Rachel med å flykte. Men Pauls hat kan forpurre det hele.