צוותים של אנשים שהלכו לעולמם לא מזמן, הושבו לתחייה וצוידו בכלי נשק מתקדמים, חייבים לשתף פעולה כדי להביס צבא של מפלצות בטוקיו ובאוסקה.

בעקבות ניסיון התנקשות בנשיא ארה"ב פורצת מלחמה בין בני האדם למוטנטים. האחרונים חייבים כעת לפעול יחדיו נגד גנרל אנושי המאיים להשמידם.

כאשר פוליטיקאי שמרן מבקש לפעול נגד בעלי הכוחות העל טבעיים, מחליט מגנטו להתנקם בבני האדם. מולו ניצבת חבורת האקס-מן.

הסרט שיצא בעקבות האלבום הקלאסי של הביטלס. מסע סוריאלסטי וחסר חוקים של קבוצת בריטים, בינהם ארבעת המופלאים, באוטובוס פסיכדלי. במהלך המסע יקלעו הנוסעים לשלל הרפתקאות מוזרות ומסתוריות המעוטרות בכמה מהשירים היפים ביותר של הלהקה כמו The Fool on the Hill ו- Your Mother Should Know. הסרט, שלפי חזונו של פול מקרטני היה חסר תסריט ומאולתר לחלוטין, בוים וצולם על ידי חברי הלהקה עם קצת עזרה מהבמאי ברנרד נולס.

אנימציית הרפתקאות המבוססת על סדרת הסרטים האהובה. ניק דיילי מהסס להפוך לשומר לילה במוזיאון וקחמונה חוזר לכבוש את העולם.

בעוד המלחמה בין מחנות המוטנטים היריבים גוברת על רקע ניסוי המאיים לגזול מהם את כוחותיהם ולהפכם לרגילים, חוזרת גריי עם כוחות מסוכנים מתמיד.

אליס משוטטת בעולם בחיפוש אחר כל הניצולים שנשארו מהתפרצות הוירוס. היא גם באה פנים אל פנים עם היריב האמתני שלה, אלברט וואסקאר, בפעם הראשונה בסדרה. כשהיא נכנסת ללוס אנג'לס החרבה, היא מועדת לתוך הבסיס של אמברלה שמוקף על-ידי זומבים, ושם היא מתחברת עם קבוצה של ניצולים שהתחבאו בלוס אנג'לס מאז התפרצות הוירוס ועוזרת להם לשחרר עוד קבוצה שמוחזקים בבית הסוהר למעלה בינם האח של קלייר ראדפילד, כריס ראדפילד.