بعد مرور عامين على مكافحة (بيتر باركر)، يشعر بعدم السعادة وتبدأ حياته في الانهيار، بعد أن وجد (ماري) الفتاة التي يحبها مغرمة بشخص آخر، كما تبدأ الصحف في القول بأنه مجرم، فيقرر ألا يواجه الجريمة مرة أخرى، لكن يظهر (دكتور أوتو أوكتافيوس) الذي يقوم بعمل شيء شرير وخطير، فيعود بيتر لمهامه من جديد.
عندما تنتقل الفتاة ذات الشعر الأحمر إلى حي تشارلي المشهور بإخفاقه في كل ما يفعل، يصبح مفتوناً بها، ويحاول بمساعدة صديقه سنوبي إيجاد طريقة لإثارة إعجابها.
يحصل (الرجل العنكبوت) على مفتاح المدينة نتيجة لجهوده في إنقاذ حياة ابنة العمدة، والمدينة ككل، ونتيجة لذلك يصيبه الغرور، وتتوتر العلاقة بينه وبين حبيبته (مارى جين)، ويواجه بعد ذلك مخلوقًا طفيليًا قادمًا من الفضاء الخارجى لديه القدرة على إضفاء روح عدوانية شريرة.
رحلة إلى مكان لا يوجد فيه شيء كما يبدو! رحلة عميقة في أرض مجهولة وغادرة ، حيث تنتظر مخلوقات خيالية كلاديس الأسطورية - عائلة من المستكشفين الذين تهدد اختلافاتهم بالإطاحة بمهمتهم الأخيرة والأكثر أهمية إلى حد بعيد.
يذهب (سبونج بوب) في مهمة من أجل كشف مؤامرة لسرقة وصفاته، حيث يتصارع مع القرصان الخطير برجر بيرد والذي يسعى لتنفيذ مخطط شرير بواسطة الوصفات السحرية لـ(سبونج بوب)، والذي سيعرض كل سكان المدينة للخطر، والطريقة الوحيدة الممكنة لاسترجاع الوصفات هو أن يترك (سنوبج بوب) عالمه المائي وأن يسافر عبر الزمن لاسترجاع وصفاته.