Rok 1936. Pisarz Miguel de Unamuno, czołowy hiszpański intelektualista, postanawia publicznie wesprzeć rebelię wojskową. Wierzy, że przywróci ona porządek w kraju. Zostaje za to odwołany przez lewicowy rząd ze stanowiska dziekana Uniwersytetu w Salamance. W międzyczasie generał Franco rozpoczyna kampanię, planując przejęcie władzy. Konflikt staje się krwawy, a część przyjaciół pisarza zostaje uwięziona, co zmusza go do zakwestionowania początkowego wsparcia dla nowej władzy.

Akcja rozgrywa się w nazistowskim obozie koncentracyjnym, należącym do zespołu Konzentrationslager Mauthausen-Gusen. Więzień Francisco Boix w rzeczywistości został tam osadzony w 1941 roku. W filmie poznajemy młodego Hiszpana, kiedy już wprawnie wykonuje przydzielone mu zajęcie – fotografuje. Francisco pod okiem niemieckich oprawców robi zdjęcia więźniom, którzy są przyprowadzani do jego prowizorycznego studia. Próbuje fotografować także niepostrzeżenie i prowadzić dokumentację wydarzeń w obozie. Zamierza pokazać światu okropieństwa, których jest świadkiem.

Aby uniknąć kary, republikański weteran hiszpańskiej wojny domowej z pomocą żony ukrywa się w domu przez ponad 30 lat. Film oparty na faktach.

Podczas wojny domowej w Hiszpanii w latach 1936-1939 zniszczono i splądrowano 2000 kościołów, zakazano praktyk religijnych i dokonywano rzezi na katolikach. Bestialsko zamordowano ponad 8000 osób duchownych. Byli wśród nich biskupi, zakonnice, klerycy. Przez cały czas krwawych prześladowań obiecywano im darowanie życia pod warunkiem wyrzeczenia się wiary, a jednak nie odnotowano żadnego przypadku apostazji! "Zakazany Bóg" to piękna i wzruszająca historia 51 błogosławionych męczenników z Barbastro: mężnych księży i kleryków – ofiar nienawiści do wiary w Boga. Ich cudem ocalałe notatki z więzienia są jednymi z najpiękniejszych świadectw wiary w dziejach chrześcijaństwa.