Satsuke a její malá sestřička Mei se společně s tatínkem stěhují do nového domu na venkově. Jejich maminka je v nemocnici, tatínek má hodně práce, a tak oběma zůstává spousta času na seznamování se s novým domovem. Brzy poznají, že dům a jeho okolí jsou obývány nejrůznějšími kouzelnými bytostmi. Díky zvědavé Mei narazí na dobráckého lesního ducha Totora, se kterým za krátko zažijí nejedno úžasné dobrodružství.

Píše se rok 2029, kvůli neustále narůstajícím problémům s hackery byl zřízen zvláštní útvar Sekce 9. Hlavním cílem jejich aktivit je aktuálně hacker známý jako "Pán loutek", nabourávající se do kybernetických mozků významných osobností i obyčejných lidí. Agent Batou a jeho partnerka Motoko Kusanagi, která disponuje stoprocentně kybernetickým tělem, se pouštějí do napínavého lovu, na jehož konci již nic nebude tak jednoznačné jako dříve.

Dokumentaristka Genya Tachibana vypátrala legendární herečku Chiyoko Fujiwara, která na vrcholu své kariéry záhadně zmizela. Když jí předloží klíč, který ztratila a o němž si myslela, že je navždy pryč, nemohl filmař tušit, že odemkne nejen dlouho skrývané tajemství Čijokoina života... ale i jeho vlastního.

Raphael, Leonardo, Michelangelo a Donatello. Kdo by neznal čtyři „želváky“, kteří jako komiksové postavy patří už celá léta k absolutním hvězdám nejen dětského světa. Žijí v newyorské kanalizaci a díky radioaktivnímu záření zmutují do lidské velikosti. Pod vedením mistra Třísky, krysího muže, se naučí bojovým uměním a spřátelí se s televizní reportérkou April. Pomáhají lidem a hlavně vedou úspěšný boj proti asijskému gangu, v jehož čele stojí tajemný Trhač. Ten se rozhodne želvy odstranit a unese mistra Třísku. Naši nindžové to ale nenechají jen tak a vyráží mu na pomoc...

Díky záhadné tekutině je možné vytvořit nové zmutované tvory. Zlý Trhač je chce použít proti želvím nidžům. Mladý chlapec Keno rozváží pizzu. Při jedné rozvážce přistihne bandu lupičů, kteří kradou zboží. Jelikož dobře ovládá bojová umění, postaví se neohroženě proti nim, a než se vzpamatuje, má po boku tři želví nindži, s jejichž pomocí lupiče porazí. V téže době se probouzí k životu Trhač, který nindžům přísahá pomstu. Mezitím urychleně pokračuje likvidace odpadu na skládce podniku TGRI; právě tekutina, která odtamtud kdysi unikla, způsobila mutaci želv a krys a stále ještě ohrožuje vše živé. Profesor Jordan Perry už zlikvidoval prakticky všechny láhve, zbývá jen jedna jenomže ta se dostane do rukou Trhače a jeho pěšáků, Trhač navíc zajme i samotného profesora, jehož donutí, aby vytvořil další příšerné zmutované tvory, kteří by mu pomohli nindži zprovodit ze světa..

Na počátku démonický zloduch a polykač duší Shang Tsung různými úskoky přiláká na palubu starobylé plachetnice skupinu bojovníků – mnicha Liu Kanga, který chce pomstít smrt svého mladšího bratra, herce Johnnyho Cage, kterého už nebaví hrát v hloupých filmech, policistku Sonju Bladeovou, která pronásleduje nebezpečného zločince. Loď trojici odveze do jiné dimenze, kde se má na tropickém ostrově celý turnaj konat. Jejich rádcem a duchovním vůdcem se stane mystický Lord Rayden, bůh hromu a blesku. Ten hrdinům odhalí, že jejich vítězství či prohra rozhodne o příští budoucnosti světa, protože nejde o obyčejný turnaj, ale o mystické střetnutí dobra a zla.

Želvy cestují časem zpět do dob starověkého Japonska, kde mohou trénovat bojová umění.