1936. urtea. Indiana Jones arkeologia irakaslea da, eta abentura arriskutsuak bizitzeko prest dago altxor historikoak lortzeko. Estatu Batuetako gobernuak Itun Arka galdu bat bilatzeko eskatzen dio, kondairak dionez mugagabeko boterea ematen omen du berau lortzen duenak, eta hori dela eta naziekin egingo du topo bilaketa horretan.
Hirugarren film honetan protagonistaren aita (hau ere arkeologoa) bahitu egiten dute Grial Santua bilatzen ari zen bitartean. Indiana Jonesek misio bikoitza dauka beraz: aita erreskatatzea eta Grial Santua aurkitzen saiatzea.