Godina je 1926. i Newt Scamander upravo je dovršio svoje dugačko putovanje po svijetu kako bi pronašao i dokumentirao nevjerojatan raspon čarbonih stvorenja. Došavši u New York kako bi se nakratko odmorio, on je možda mogao doći i otići bez ikakvog incidenta… da se na njegovom putu nisu našli No-Maj zvani Jacob, zaboravljeni čarobni kovčeg, te bijeg nekih od Newtovih čarobnih zvijeri, koji bi mogao označiti veliku opasnost kako za svijet čarobnjaka, tako i No-Maja.

Mladi miš po imenu Fievel i njegova obitelj odlučuju migrirati u Ameriku, "zemlju bez mačaka", na prijelazu u 20. stoljeće. Ali Fievel u Novom svijetu završi sam, i mora se ne samo braniti od mačaka s kojima se nije mislio ikad ponovno suočiti, već i nositi s usamljenosti daleko od kuće.

U Manhattanu žohari šire smrtonosnu zaraznu bolest koja uzima stotine života gradske djece. Stoga entomologica Susan Tyler (Mira Sorvino) koristi tehnike genetskog inženjeringa kako bi stvorila ono što ona i njezin kolega i suprug Peter Mann (Jeremy Northam), nazivaju Juda vrstom (Judas Breed). Juda vrsta je zapravo naziv za krupne kukce koji se hrane štetočinama koje prenose prethodno spomenutu zaraznu bolest. Mutantska je vrsta trebala izumrijeti nakon samo jedne generacije no nakon tri godine Susan otkriva kako je vrsta uspjela ne samo preživjeti nego toliko napredovati da mogu oponašati ljudski oblik i uništiti čovječanstvo.

Godina je 2079. Ugledni znanstvenik Spencer Olham radi na stvaranju tajnog oružja koje bi konačno trebalo okončati dugogodišnji rat s vanzemaljcima. Stvari se zakompliciraju kada Olham bude optužen da je izvanzemaljski špijun zbog čega za njim kreće međunarodna potjera. Čak i njegova supruga nije sigurna može li mu vjerovati. Spencer sada mora pronaći način da dokaže istinu i tako spasi sebe, ali i cijelu ljudsku rasu.