מציאותה של מימה, כוכבת פופ לשעבר שמתחילה בקריירת משחק, מתחילה להתערער כשמעריץ אובססיבי מתחיל לעקוב אחריה וכשרוח של דמות העבר שלה מתחילה לרדוף אותה.
כשפאזו, שוליית מהנדס, מביא את ארוחת הערב של אדונו אל המכרה, נוחתת בידיו נערה חסרת הכרה מהשמיים. נערה זו, שיטה, ותליון אבן הריחוף שלה, מחזיקים במפתח לטירה מרחפת מסתורית ודמיונית הידועה בשם לפוטה. שיטה ופאזו חייבים להימלט גם משודדי האויר שרוצים את האוצר האגדי של הממלכה המרחפת, וגם מהצבא המובל ע"י סוכן ממשלתי בעל תכניות מסתוריות משלו ללפוטה.
לאחר שנראה שהם הביסו את אויבם המשותף, נאראקו, עניין שנראה כסוף מסעם, מגיע איום חדש בפני אינויאשה והחבורה בדמות נסיך השדים המסתורי קאגויה.
אי שם במעבדה סודית, מנסה חבורת מדענים ליצור מחומר גנטי שהופק משערה מאובנת של מיו, את הפוקימון האגדי, החזק מכולם מיוטו.אלא הדברים מסתבכים, ובמקום הפוקימון המופלא נוצרת מפלצת הנשבעת לנקום בעולם.כך מוצאים את עצמם אש וחבריו, מעורבים בסידרת הקרבות העולמיים, בהשתתפות חבורה של מאמנים, כל אחד מהם רוצה להיות מאסטר פוקימון.
ב-1866, לונדון וריי סטים ההמציא מקבל חבילה אפופת מסתורין מסבו - כדור זעיר המיועד להיות מנוע קיטור מזערי עוצמתי ביותר, שכוחו גובר על הדומים לו. וזה מתרחש, מתנתו של ריי הופכת להיות מיוחסת כפלא טכנולוגי, או סכנה ואיום לעולם. קבוצת סוכנים מרושעים "יסוד אוהרה", יודעת הכל אודות הכדור המזערי, ונחושים בדעתם להשיגו. אדי, אביו של ריי, נלקח תחת שלטונו של אוהרה וברגע שגילה כי בנו מחביא את הכדור באחד מביתני התערוכה, הוא מנסה להסיח את דעת הסוכנים מהכדור ולהרחיקם מהמטרה. אך ריי מגלה שהוא אינו היחיד בעל מנוע הכדור המזערי, אלא התערוכה כולה מופעלת ע"י רבים כמוהו, וקבוצת סוכני "אוהרה" משתמשים באולם המבצר הקרבי למהר ולנצל את זמנם.
לעולמנו יש יקום מקביל – עולם של חושך ורשע. אנשים מעטים מאוד מודעים לקיומו ובני-האדם מעבירים את חייהם בשלווה יחסית. מאות שנים התקיים בין שני העולמות הסכם ששמר על השלום, אבל תוקפו של ההסכם מתקרב לסיום ויש צורך לקבוע תנאים וחוקים חדשים בשביל לשמור על הסטטוס-קוו. קבוצה קיצונית שיעדיה שונים לחלוטין, רוצה לסכל את יצירת ההסכם החדש ותעשה הכל בשביל לחבל במאמצים לשמור על השקט. זוג סוכנים בארגון ה-"מגינים השחורים" – ארגון שאחראי על שמירת האיזון בין העולמות – מקבלים משימה להבטיח את הצלחת ההסכם. זוג הסוכנים הם טאקי רנזבורו, מוכר אלקטרוניקה ביום ו-"מגן שחור" בלילה, ולצידו מאקי, אישה מעולם החושך שמסווה את עצמה בעולם בני-האדם כדוגמנית יפהפייה. משימתם היא להגן על ג'וזפה מיארט, אדם משונה בן 200, שחייב להיות נוכח בחתימת ההסכם.
דיונן ובריארוס הם שני לוחמים בניו-יורק פוסט אפוקליפטית, הנשלחים בידי שליט האזור לחסל רובוטי תקיפה הנמצאים בקצוות העיר. במהלך משימתם, השניים מצילים את איריס ואולסון, שני לוחמים השייכים לאזור בטוח מיתולוגי בשם האולימפוס, ואשר מבקש להפיל את שלטון הטרור בניו-יורק. דיונן ובריארוס מחליטים לנטוש את משימתם ולהצטרף למחתרת כדי לעזור לה בניסיון ההתנגדות.