Pol roka po biologickej katastrofe, ktorá zabila 99% obyvateľov Británie, armáda vyhlási, že boj s vírusom úspešne vyhrala, takže utečenci sa môžu vrátiť a začať s obnovou krajiny. Patrí k nim aj Don Harris so svojou ženou Alicou a dvoma deťmi, ktorí nákazu prežili. Nikto však netuší, že vírus nebol zničený úplne...
Tajomná spoločnosť Umbrella Corporation, zaoberajúca sa genetickým výskumom, realizuje vo svojich rozsiahlych podzemných laboratóriách veľmi nebezpečné pokusy. V nečakanej chvíli unikne smrtiaci vírus a centrálny počítač laboratória - Red Queen - uzavrie celú zasiahnutú oblasť podzemného labyrintu a nechá zamestnancov, zasiahnutých vírusom, vo vnútri priestoru. Elitné komando na čele s Alicou (Milla Jovovichová) a Rain (Michelle Rodriguezová) dostane úlohu, ktorá je otázkou života a smrti. Musia izolovať vírus a zistiť príčinu jeho úniku. Čoskoro však zistia, že všetko je ešte horšie ako čakali. Vírusom zasiahnutí zamestnanci nie sú ani živí ani mŕtvi. Teraz sú z nich mimoriadne agresívni zombie - nesmrteľné beštie, ktoré sa skrývajú na mieste katastrofy.
Alice bola jedným z dvoch ľudí, ktorí vyviazli z katastrofy, čo premenila podzemné laboratóriá mamutej biochemickej korporácie Umbrella Corporation na smrtiacu pascu. Druhým bol Matt Addison, muž, ktorý chcel pôvodne odhaliť nekalé machinácie mocnej firmy. Spolu s Alice unikol z tajného centra Umbrelly zamoreného hladnými zombie a bleskurýchlymi mutantmi. Sám sa však stačil nakaziť nebezpečným T-vírom a vedci z Umbrelly sa rozhodli zneužiť ho na ďalšie experimenty. Teraz sa Alice znovu ocitá na prahu zlého sna. Spustošené Racoon City sa zmenilo vinou T-víru na mesto živých mŕtvych. Bývalí zamestnávatelia mladú ženu aj tentoraz vháňajú do súboja, v ktorom musí bojovať a zabíjať, alebo bude sama zabitá. Jej hlavným protivníkom je teraz monštrum Nemesis. A nie je to nikto iný ako hrozne premenený Mat.
Nastal koniec sveta. Pokusný T-vírus, vyrobený spoločnosťou Umbrella, bol vypustený do sveta a premenil jeho obyvateľstvo v hordu potácajúcich sa zombie, ktoré majú v obľube mäso. Pretože v mestách nie je bezpečne, dávajú Carlos Oliviera a LJ dohromady skupinku preživších, medzi ktorými sú aj nováčikovia Claire, K-Mart a sestra Betty, a vydávajú sa na cesty. Presúvajú sa v ozbrojenom konvoji po opustených púštnych diaľniciach. Hľadajú ďalších svojho druhu - tých, ktorí prežili, nenakazených. Nachádzajú ale tých, ktorých je v púšťach plno: nemŕtvych. A budú potrebovať množstvo zbraní, tisíce nábojov a pár plameňometov, aby sa ubránili. Pod opusteným vysielačom v Nevade sa ukrývajú špičkové kancelárie a laboratória spoločnosti Umbrella. Dr Isaacs, ktorý má neustály prístup k špionážnemu satelitu, sleduje púť konvoja, ale hľadá pritom osobu, ktorá je nielen kľúčová pre vznik lieku, ale taktiež stelesňuje všetko, o čo sa experimenty spoločnosti Umbrella pokúšali. Tou osobou je Alice.