Szósty film o Godzilli. Obcy z Planety X nawiązują kontakt z ziemskimi astronautami. Pragną oni "pożyczyć" Godzillę i Rodana, gdyż mają na swojej planecie problem z Gidorą. W zamian oferują cudowne lekarstwo, które leczy każdą ziemską chorobę. Kiedy już Godzilla, Rodan i Gidora znajdują się w posiadaniu kosmitów... ogłaszają oni, że przejmują kontrolę nad Ziemią. Aby pokazać, że nie żartują zrzucają potwory na... Tokio. Wydaje się, że już nic nie może uratować Ziemi. Jednak chłopak siostry jednego z astronautów stworzył pewien wynalazek, który może powstrzymać obcych...
Planeta karaluchopodobnych kosmitów umiera. Wysłani, by skolonizować Ziemię, z tajnej kryjówki w parku rozrywki, obcy kontrolują dwa kosmiczne potwory - Gigana i Króla Ghidorę. Z ich pomocą pragną zniszczyć ludzi i przejąć planetę. Powstrzymać ich mogą jedynie połączone siły Godzilli i Anguirusa.
Godzilla zamierza uratować swoje dziecko przed atakiem zmutowanych insektów, które powstały w wyniku radioaktywnego deszczu.