Det er Harrys tredje år på Galtvort. Sirius Svart er ute etter den unge trollmannen, sjeleslukende desperanter kretser truende over skolen, mens en tilhenger av den avskyelige Han-du-vet lurer innenfor slottets murer. Og Harry vil bli tvunget til å konfrontere dem alle.
En psykologisk thriller om en åtte år gammel gutt som heter Cole Sear, som tror han kan se inn i de dødes verden. En barnepsykolog ved navn Malcolm Crowe kommer til Cole for å hjelpe ham med å håndtere sitt problemer, finner han ut at gutten virkelig kan se spøkelser - døde mennesker.
Foreldreløse Harry får et nytt liv når han kommer inn på trollmannsskolen Galtvort. Her oppdages snart det magiske arret i pannen hans, og det synes klart at gutten er eslet til noe stort.
Når Harrys navn trekkes fra ildbegeret, må han delta i en tøff kamp om ære mellom tre trollmannsskoler. Men siden han aldri meldte seg på turneringen selv, hvem var det da som gjorde det? Denne må Harry kjempe mot en fryktinngytende drage, olme vanndemoner og en forhekset labyrint, bare for å oppdage at han befinner seg i fyrst Voldemorts jerngrep.
Dette skoleåret ved Galtvort byr på snakkende edderkopper og brev som brøler, og Harrys urovekkende evne til å snakke med slanger skaper splid mellom ham og vennene hans. Når en blodig innskrift på veggen forkynner at "mysteriekammeret er åpnet", blir det for alvor farlig.
Mange i trollmannssamfunnet tror at Harrys nylige konfrontasjon med onde fyrst Voldemort er en løgn, og hans integritet trekkes i tvil. Et møte med desperanter, der fetter Dudleif havner i fare, fører til en høring i Magidepartementet. Enda verre er det at magiminister Kornelius Bloeuf har utnevnt en ny lærer i forsvar mot svartekunster - den manipulerende Venke Dolorosa Uffert.
Fyrst Voldemort strammer sitt grep, og Galtvort er ikke lenger noe trygt sted å oppholde seg. Harry mistenker at farene kan lure til og med inne på slottet, men Humlesnurr er mer opptatt av å forberede ham på den nært forestående, siste kampen. Det avgjørende oppgjøret nærmer seg raskt, men kjærligheten blomstrer likevel - selv om Galtvort kanskje aldri vil bli som før.