Antonius Block a vitéz és fegyverhordozója, Jöns a keresztes háborúból térnek vissza. Lepusztult földeken, dühöngő járványok között vezet útjuk. Block a vándorlást úgy tekinti, mint a megismeréshez, tudáshoz vezető utat. Minden áron tudni akar. Ha Isten hallgat, kész megkérdezni a Sátánt. Jonsot nem foglalkoztatják túlságosan ura metafizikai kételyei. Úgy örül az életnek, ahogyan az van. Nem veszi észre a Halált, amely egyedül készséges elbeszélgetni Block-kal és sakkjátszmát folytatni vele. Utazásuk során a legszörnyűbb erőszaknak és önkorbácsoló menetnek szemtanúi. Találkoznak egy rémült fiatal lánnyal, akit boszorkányságért halára ítéltek és egy különös bűvészcsaláddal, akiket Block megment a halál elől. Az utolsó vacsora után, amelyet Block feleségének várában költ el, a Halál egy igazságkeresőt és saját megvilágosodását hozza magával.
A sikeres Playstation játék, a Final Fantasy VII. történetét folytató filmben két év telt el azóta, hogy Midgar romjai a béke megteremtéséért hozott áldozatok örök mementójaként állnak. A világra azonban hamarosan új veszedelem leselkedik: egy viharos gyorsasággal terjedõ rejtélyes betegség. A régi ellenségek is megélénkülnek, így Cloud, aki megannyi hõstett után visszavonult, és a magányos életet választotta, ismét színre kell hogy lépjen - ezúttal ebben az egész estés filmben!
A film a jövőben játszódik, amikor az emberek többsége játékfüggőségben él. Az új találmány átlép minden korábbi korlátot: nincs szükség monitorra vagy sisakra, ugyanis a játék csatlakozóját az emberi szervezetbe ültetik be. Az eXistenZ a központi idegrendszeren keresztül kelti a tökéletes valóság illúzióját. A játékban a főhősnek menekülnie kell az őt üldöző merénylők elől. A leghátborzongatóbb az egészben az, hogy a valóság és az illúzió határai könnyen elmosódhatnak
1582-ben indul a történet. Oda Nobunaga csatározása nyomán sikerült egyesíteni az országot, ám egyik vezére, Akechi Mitsuhide elárulta, és megölte. Ő sem élt sokáig, Nobunaga utódja, Toyotomi Hideyoshi kezébe kerül a hatalom. Elődje munkáját befejezvén végre béke van, a főváros akkoriban egyébként Kyoto. Itt él a híres tolvaj, Goemon, aki a zsákmányt a szegények közt osztja szét. Ámde egy nap talál a sok kincs közt egy dobozkát is, amit már sokan keresnek..