Jack Skellington é o Rei das Abóboras na cidade de Halloween mas está entediado após anos a repetir sempre as mesmas coisas na Noite das Bruxas. Certo dia, por acaso, descobre a cidade do Natal e fica tão impressionado que decide trazer o espírito natalício para as festas do Halloween.

Viajantes no tempo vêm de 2051 com uma mensagem urgente: daqui a 30 anos, a humanidade perderá uma guerra contra alienígenas mortíferos. A única esperança para a sobrevivência é que soldados e civis sejam levados para o futuro para lutar. Determinado a salvar o mundo pela filha, Dan Forester alia-se a uma cientista brilhante e ao próprio pai, que o abandonara, para alterar o destino do planeta.

Peter LaFleur é dono de um ginásio de bairro, que sobrevive de uma pequena clientela. O local atrai a atenção do egocêntrico White Goodman, dono de um império de ginásios. White pretende comprar o pequeno ginásio de Peter, mas falha e nasce uma rivalidade entre ambos, com Goodman abrindo um ginásio enorme do outro lado da rua. A possibilidade de salvação de Peter LaFleur surge no campeonato de queimada, que terá por prémio a quantia que LaFleur precisa para saldar a sua dívida e salvar o seu ginásio.

No ano de 1882, Sanshirou chega a Tóquio em busca de um professor digno de artes marciais. Aí, conhece Yano – um mestre de judo que sozinho derrota 39 praticantes de jiu-jitsu. Extremamente impressionado com a sua capacidade, Sanshirou decide tornar-se seu discípulo. Mais tarde, Sanshirou apaixona-se por Sayo Murai - uma rapariga cujo pai é instrutor de artes marciais no departamento de polícia local; e terá também de enfrentar Higaki Gennosuke, um habilidoso lutador de jiu-jitsu e o seu maior rival.