Uma Thurman je morilka, ki jo na njen poročni dan napadejo člani bande njenega šefa Billa (David Carradine). Uspeva preživeti napad, čeprav ostaja v komi. Pet let pozneje se zbudi s koščkom kovine na glavi in veliko željo po maščevanju v srcu.
Potem ko je izločila nekatere člane tolpe, ki so jo poskušali ubiti na njen poročni dan, se "Mamba Negra" nadaljuje s maščevanjem in poskuša dokončati preostalo tolpo, zlasti svojega nekdanjega šefa Billa, ki jo je pustil mrtvo in jo zapustil v komi.
Borci za svobodo Neo, Trinity in Morpheus se še naprej upirajo vojski digitalnih strojev z umetno inteligenco. Da bi preprečili iztrebljenje človeštva, morajo še bolje spoznati Matrico in ključno Neovo vlogo v igri za usodo sveta.
V zaključku trilogije "Matrica" se Neo (Keanu Reeves), Morpheus (Laurence Fishburne) in Trinity (Carrie-Anne Moss) borijo, da bi zadnje človeško mesto Sion ubranili pred ubijalskimi stroji, ki so si podjarmili in zasužnjili človeštvo.