Η πλοκή της ταινίας τοποθετείται χρονικά στο 1995, έντεκα χρόνια μετά τα γεγονότα της πρώτης ταινίας. Ο Τζον Κόνορ, σε ηλικία έντεκα ετών, ζει με τους κηδεμόνες του στο Λος Άντζελες. Η μητέρα του Σάρα Κόνορ, προετοίμαζε τον Τζον ώστε να εκπληρώσει το μελλοντικό του καθήκον. Συνελήφθη ωστόσο, μετά από απόπειρά της να βομβαρδίσει ένα εργοστάσιο με υπολογιστές και στη συνέχεια μεταφέρθηκε σε ψυχιατρική κλινική. Μετά την πρώτη, ανεπιτυχή απόπειρα του υπερυπολογιστή Skynet να εξοντώσει την Σάρα Κόνορ, στέλνει πίσω στο χρόνο έναν νέο, ακόμα πιο εξελιγμένο, σάιμποργκ εξολοθρευτή, τύπου Τ-1000, προκειμένου να εξοντώσει αυτήν τη φορά, τον ίδιο τον Τζον Κόνορ. Παράλληλα, ο μελλοντικός Τζον Κόνορ, στέλνει έναν επαναπρογραμματισμένο εξολοθρευτή τύπου Τ-800, όμοιο με αυτόν που καταδίωκε την Σάρα Κόνορ στην πρώτη ταινία, αυτήν την φορά για να προστατεύσει τον ίδιο (ακόμη σε νεαρή ηλικία) και την μητέρα του.
1988, η Νέα Υόρκη έχει μετατραπεί σε μια τεράστια φυλακή, όπου οι εγκληματίες αφήνονται να επιβιώσουν με όποιο τρόπο μπορούν. 1997, ο πρόεδρος των ΗΠΑ, μετά από μια αεροπειρατεία στο προεδρικό αεροσκάφος, καταλήγει αιχμάλωτος στην Νέα Υόρκη. Σε έναν νεοεισαχθέντα κατάδικο, προσφέρεται αμνηστία με την προϋπόθεση να τον σώσει εντός 24ώρου.
Το "Degeneration" συνεχίζει εφτά χρόνια μετά τα γεγονότα που συνέβησαν στην Raccoon City όπως διαδραματίζονται στα παιχνίδια. Ο λιμός των Ζόμπι έχει σταματήσει... ή μήπως όχι; Όχι ακριβώς επειδή αυτό που εμφανίζεται για ένα γεύμα στο αεροδρόμιο, μοιάζει πολύ με ζόμπι. Αλλά αυτή την φορά η Εταιρία Umbrella έχει διαλυθεί, ποιος λοιπόν θα μας σώσει; Εντάξει, δεν ήταν η Umbrella που μας έσωσε την προηγούμενη φορά αλλά φαινόταν να έχουν πολλούς Κομμάντο που θα πολεμούσαν τα ζόμπι και αυτό είναι πάντα καλό όταν είσαι περιτριγυρισμένος από τους Απέθαντους.
Έτος 2274 κι επιφανειακά η κοινωνία είναι τέλεια. Κλεισμένοι από έναν τεράστιο θόλο, οι κάτοικοι έχουν ελάχιστη ως καθόλου εργασία κι απλά απολαμβάνουν τη ζωή τους. Όμως, όταν κάποιος φτάνει τα 30, μέσω μια θρησκευτικής τελετής η ζωή τερματίζεται. Κάποιοι, γνωστοί ως «δρομείς», αντιστέκονται αλλά υπάρχει ασφάλεια που τους βρίσκει και τους εξοντώνει. Ένας από τους κατοίκους, ο Λόγκαν, παίρνει εντολή να κάνει τον δρομέα, να βγει από τον θόλο και να βρει τρόπο να εξοντωθεί η αποικία των επαναστατών. Όταν, όμως, φτάνει εκεί μαζί με μια βοηθό του, βλέπει πως άλλος είναι ο ιδεατός κόσμος.
Φωτογράφος μόδας την μέρα, ο Όστιν Πάουερς μεταμορφώνεται το βράδυ σε τέλειο τζέντλεμαν-κατάσκοπο! Μετά από "κρυογονική" κατάψυξη στο απόγειο της δόξας του το 1967, τώρα τριάντα χρόνια μετά ο Όστιν αποψύχεται για να αντιμετωπίσει τον αιώνιο αντίπαλό του Δρ Κακό, που για άλλη μια φορά κρατά σε ομηρία ολόκληρο τον πλανήτη!
Τη μελλοντική αυτή εποχή, κυριαρχεί ένα δημοφιλές τηλεοπτικό παιχνίδι, στο οποίο καλούνται να λάβουν μέρος όλοι οι εγκληματίες, με τίμημα την ελευθερία ή το θάνατο - ένα παιχνίδι βίαιο και σκληρό, που χωρίζει τους συμμετέχοντες σε κυνηγούς και κυνηγημένους. Ο `Αρνολντ Σβαρτζενέγκερ υποδύεται έναν τέτοιο κατάδικο, που παίρνει μέρος στο παιχνίδι ως κυνηγημένος. Ντυμένος με ελάχιστα ρούχα και εφοδιασμένος με περίεργα όπλα, ο μυώδης σταρ του Χόλιγουντ μοιάζει με αρχαίο Ρωμαίο μονομάχο, που αγωνίζεται να σώσει τη ζωή του, καταδιωκόμενος από άσπλαγχνους διώκτες.
Με την κατάχρηση τον φυσικών πόρων ή με τη συνεχή καταστροφή της φύσης κάποια στιγμή στο μέλλον η γη θα μας εγκαταλείψει. Ποια θα είναι όμως η σωτήρια μας; Η επιστήμη ή η πίστη μας; Η ταινία αυτή, που περιμέναμε με τόση ανυπομονησία, ήρθε να δώσει μια εντελώς διαφορετική και -όπως φαίνεται από τον τίτλο της- αναπάντεχη διάσταση σε αυτά τα ερωτήματα. Λίγα λόγια όμως για την ιστορία της. Στο μέλλον η γη είναι κατεστραμμένη και η φύση εντελώς νεκρή μετά την πτώση ενός μετεωρίτη. Ο μετεωρίτης αυτός όμως περιείχε και κάποια όντα τα οποία άρχισαν να επιτίθενται σε όσους κάτοικους είχαν επιζήσει. Μια ομάδα επιστημόνων έχει βρει τρόπο αντιμετώπισης αυτών των εξωγήινων με έναν παράδοξο τρόπο. Πάντρεψαν την επιστήμη με την πίστη στις υπερφυσικές δυνάμεις. Αυτό όμως τους φέρνει σε σύγκρουση με τους στρατιωτικούς και πολιτικούς παράγοντες οι οποίοι θέλουν να απαλλαγούν όσο το δυνατόν πιο γρήγορα από αυτή την απειλή.
Δέκα χρόνια έχουν περάσει από τότε που ο Τζον Κόνορ απέτρεψε τη «Μέρα της Κρίσης». Οι μηχανές δεν φαίνεται να μπορούν να τον εντοπίσουν, ως τη στιγμή που, από τα σκοτάδια του μέλλοντος θα ξεπηδήσει η Τ-Χ, η πιο εξελιγμένη φονική Μηχανή. Μοναδική ελπίδα όλων είναι ο Τ-800, ο μυστηριώδης Εξολοθρευτής, που θα αναλάβει να προστατεύσει τον Τζον, ενώ η Εξέγερση των Μηχανών είναι έτοιμη να ξεσπάσει
Μία εκδοχή του μέλλοντος του 1970, όπου οι προσωπικότητες συγκρούονται με τους αστεροειδείς…