Nicholas Van Orton (Michael Douglas) on äärmiselt rikas San Francisco ärimees, kellel näib kõik siin ilmas olemas olevat, kuid kes sellegipoolest elab eraklikku ja rõõmudevaest elu. Sellesse õnnetusse eksistentsi otustab vaheldust tuuatema noorem vend Conrad (Sean Penn), kes kingib Nickile tolle 48.sünnipäevaks kinkekaardi agentuurilt nimega CRS, mille erialaks on korraldada ebatavalisi mänge, mis tehtud mängijate nõrku ja tugevaid omadusi silmas pidades. Algul on Nicholas kummalise kingituse suhtes küll äärmiselt skeptiline, kuid mõne aja pärast saab uudishimu temast võitu, ta külastab agentuuri ning ühel pealtnäha ilusal päeval algabki mäng, mis pöörab pea peale kogu tema elu. Kõik tema ümber näivad teadvat toimuvast rohkem, kui tema ning üsna pea kaovad igasugused piirid mängu ja reaalsuse vahel.

Itaalia kalalaeva meeskond päästab amneesiaki, kui see ujub merel. Tal ei ole identiteeti ega minevikku, kuid tal on terve rida erakordseid andeid keele-, võitlus- ja enesekaitsekunstis, mis viitavad riskikutsele. Segaduses ja segaduses teeb ta meeletu otsingu, et teada saada, kes ta on ja miks on tema elu võtnud sellise ohtliku pöörde.

Jason Bourne'i minevik tuleb tema jaoks tagasi. Kolme filmi saaga teises osas, mis põhineb Jason Bourne'il, endisel CIA agendil, kes kaotab mälu ja kui ta üritab seda taastada ja teada saada, kes ta tegelikult on, satub ta spionaaživõrku ja valitsuse manipuleerimine Ameerika Ühendriikide poolt, kus teda jälitavad kutselised tapjad, poolsõjaväelised palgasõdurid ja endised CIA seltsimehed. Film algab Indias Goa osariigis, kus Jason ja Marie on läinud elama Treadstone'i eest peitu, kuid seal asub ka endine ettevõte agent otsib ja jälitab neid ning jälitab neid. Jason Bourne alustab oma seiklust oma mineviku avastamisega, mäletades osa sellest ja jälitades esindajat, kes samuti poseerib temana.