داستان انیمه برگرفته از رمانی به همین نام اثر ماکوتو شینکای می‌باشد که مخلوطی از عشق و معجزه است. دو نوجوان دبیرستانی پس از اینکه متوجه می‌شوند به شکل عجیب و غریبی به هم مرتبط هستند و هرکدام در رؤیا خود را در قالب دیگری می‌بیند، تصمیم می‌گیرند برای اولین بار یکدیگر را ملاقات کنند...
یک گروه از جستجو گران با استفاده از یک سیاه چاله که به تازگی کشف شده است توانستند محدودیت های انسان در سفر های فضایی را از بین ببرند و امکان سفر به مکان های دورتر را فراهم آورند …
دانشمندان متوجه می‌شوند که برخورد تکه‌های یک ستاره‌ی دنباله‌دار در روز‌های آتی به احتمال زیاد باعث انقراض بشریت خواهد شد و تنها راه نجات از این مهلکه پناه‌بردن به گروهی از پناهگاه‌های زیرزمینی واقع در گرینلند است. این فیلم ماجرای جان گریتی را دنبال می‌کند که به‌همراه همسرش آلیسون و پسر کم سن‌وسالش ...