국제 해저 관측 프로그램으로 일환으로 심해를 탐사 중인 해저 탐험대는 정체 모를 거대 생물에게 공격을 당한다. 긴급 투입된 심해 구조 전문가 조나스(제이슨 스타뎀)는 그것이 200만년 전 멸종된 것으로 알려진 ‘메가로돈’임을 주장한다. 아무도 믿으려 하지 않지만, 조나스는 역사상 가장 위대하고 가장 거대한 포식자와 두 번째로 마주하는 것인데…
1989년 플로리다 주 바빌론. 선생님의 일을 도우러 학교로 가던 16세 소녀 마가렛이 가면을 쓴 괴한에게 공격을 당한 뒤 강물 속에서 자신의 자전거에 묶인 채 시신으로 발견된다. 소녀의 할머니와 마을 보안관은 각자 유력한 용의자를 마음에 두고 있는데 마가렛의 유령이 나타나 마을을 떠돌기 시작한다