تنطلق إلاستيقيرل إلى العمل لإنقاذ اليوم، بينما يواجه السيد خارق أكبر تحد له حتى الآن - وهو ان يعتني بمشاكل أطفاله الثلاثة.
يتبع محتالان إسبانيان مسارًا على خريطة يقودهما إلى مدينة الذهب الأسطورية في العالم الجديد، فيظن الجميع أنهما من الآلهة… وسرعان ما يواجهان موقفًا لا يُحسدان عليه.
تدور أحداث الفيلم حول شاب مغامر يدعى (ميلو) ينضم لفريق من المستكشفين الجريئين يحاولون العثور على قارة أطلانتس المفقودة.
إستكمالاً لأحداث الجزء الأول، تحاول الحيوانات العودة إلى موطنها في نيويورك، ومنهم الأسد (أليكس) بعد أن تخلى عن طبيعته المفترسة، لكن تسقط الطائرة التي صنعها البطاريق في إحدى المحميات في أفريقيا، يلتقي فيها الأسد (أليكس) بعائلته، ويحاول إثبات نسبه الملكي بالصراع مع (مكونجا)، في الوقت ذاته تكون الزرافة (ميلما) هي الطبيب الساحر الجديد، في الوقت الذي تحاول فيه البطاريق صنع طائرة جديدة للعودة إلى نيويورك.