Jafar a jeho papagáj Jago, hľadajú lampu ukrytú v Jaskyni zázrakov. Do tej však môže vstúpiť len ten, kto má srdce zo zlata, inak sa mu stane neštastie. Jafar pomocou kúziel zistí, že jediným, kto môže lampu priniesť je mladý Aladin, chudý, alebo dobrosrdečný zlodej...
Rok 1947, Hollywood. Eddie Valiant, detektív, ktorému sa lepí smola na päty, je najatý, aby našiel dôkaz, že Marvin Acme, magnát, vlastník továrne na humor a starosta Toontownu v jednej osobe, má aférku s osudovou ženou Jessicou Králikovou, ktorá je manželkou slávnej hviezdy kreslených filmov Rogera Králika. Keď však nájdu Acmeho mŕtvolu, všetko ukazuje na Rogera. Na rad prichádza Eddie, ktorý sa musí zbaviť strašnej traumy a zachrániť Toontown.
Príbeh štyroch rozmaznaných zvieratiek zo ZOO v newyorskom Central Parku, ktoré už netúžia po tom, aby sa vrátili do divočiny. Lev Alex je kráľom tejto mestskej džungle a v ZOO je hlavnou atrakciou. Spolu so svojim najlepším priateľom – zebrou Martym, žirafou Melmanom a hrošicou Glóriou žijú po celý svoj život v pokojnom zajatí, kde pravidelne dostávajú chutné krmivo a sú obdivovaní návštevníkmi. Marty však nie je celkom spokojný so svojím osudom. Prežíva svoju „krízu stredného veku“ a zo zvedavosti a za pomoci niekoľkých šikovných tučniakov ujde, aby mohol preskúmať neznámy svet. Nasleduje ho žirafa Melman, Lev Alex a hrošica Glória, ale skôr, ako sa dostanú na slobodu, sú naložení do veľkých drevených debien a nalodení na zámorskú loď plávajúcu do Afriky...
Príbeh o štyroch korytnačkách a jednom potkanovi, ktorí v kanále prídu do styku s neznámou chemikáliou a zmutujú. Neprirodzene narastú a zvýši sa im aj inteligencia. Potkan bol miláčikom japonského majstra bojových umení a v klietke sa naučil najrôznejšie pohyby, ktoré korytnačky naučil. Sám si hovoril Majster Splinter a svoje "deti" pomenoval Leonardo, Michelangelo, Donatello a Rafaelo. Korytnačky svojou znalosťou bojových umení pomáhajú ľuďom. Spriatelia sa s novinárkou April a čudáckym ochrancom zákona Caseym Jonesom, ktorý používa ako zbrane športové pomôcky. Spoločne korytnačky spôsobujú nemalé problémy ázijskému gangu, ktorý vedie tajomný Shredder a ten sa rozhodne korytnačky odstrániť.
Vďaka záhadnej tekutine je možné vytvoriť nové zmutované tvory. Zlý Shredder ich chce použiť proti korytnačkám. Mladý chlapec Keno rozváža pizzu. Pri jednej rozvážke pristihne bandu lupičov, ktorí kradnú tovaru. Keďže dobre ovláda bojové umenia, postaví sa neohrozene proti nim, a než sa spamätá, má po boku tri korytnačky, s ktorých pomocou lupiča porazí. V tej istej dobe sa prebúdza k životu Shredder, ktorý ninjom prisahá pomstu. Medzitým urýchlene pokračuje likvidácia odpadu na skládke podniku TGRI; práve tekutina, ktorá odtiaľ kedysi unikla, spôsobila mutáciu korytnačiek a potkanov a ešte stále ohrozuje všetko živé. Profesor Jordan Perry už zlikvidoval prakticky všetky fľaše, zostáva len jedna. Lenže tá sa dostane do rúk Shredderovi a jeho pešiakov.
V treťom diele sa korytnačí nindžovia a April vďaka náhodnej kúpe tajomného a čarovného žezla dostanú do stredovekého Japonska. Namiesto nich sa v súčasnosti objavia japonský princ a štvorica samurajských bojovníkov. Lenže žezlo sa stratilo pri prenose, a tak ho musí štvorica znova nájsť, aby sa dostala späť do súčasnosti. Ale tiež musí zabrániť krviprelievaniu, na ktorom si chce privyrobiť anglický bandita a predajca pušiek. Budú sa však všetci korytnačí kamaráti chcieť vrátiť späť do súčasného sveta, kde o nich nikto nevie, zo sveta, kde sa stali hrdinami? A naopak japonskí samurajovia zo sveta, kde už nie je toľko nebezpečenstva ako v minulosti?