Rio de Janeiron slummeissa isättöminä kasvaneet 18-vuotiaat kaverukset Acerola ja Laranjinha päättävät selvittää isiensä kohtalon. Etsintä panee ystävyyden kovalle koetukselle, ja menneisyyden haamut kurottavat nykypäivään keskellä slummien huumejengien välistä sotaa.
Tie Guatanamoon kertoo neljästä ystävyksestä, jotka lähtevät syyskuussa 2001 Englannin Tiptonista lomamatkalle ja päätyvät mutkien kautta Afganistaniin, jossa pohjoinen liittouma vangitsee heidät. Amerikkalaiset siirtävät pojat Guantanamon tukikohtaan Kuubaan syyttäen heitä kansainvälisiksi terroristeiksi. Pojat vapautetaan yli kahden vuoden kuulustelujen jälkeen, kun he pystyvät todistamaan, että he oleskelivat väitettynä aikana Britaniassa. Tarina kerrotaan haastattelujen, uutiskuvien ja näyteltyjen osuuksien avulla.