Amanda i jej wymyślony przyjaciel Rudger przeżywają w wyobraźni emocjonujące przygody. Pewnego razu Rudger zostaje sam i staje twarzą w twarz z tajemniczym zagrożeniem.
Troje bezdomnych znajduje w Wigilię porzucone niemowlę i wyrusza na poszukiwania jego rodziców, spotykając po drodze całe mnóstwo niezwykłych oryginałów.
Pięcioletni Sosuke mieszka wraz z mamą nad brzegiem morza. Pewnego dnia chłopiec znajduje na plaży butelkę z uwięzioną w niej złotą rybką. Sosuke ratuje ją i daje na imię Ponyo. Wkrótce okazuje się, że Ponyo nie jest taką sobie zwykłą rybką. To córka wielkiego maga i morskiej bogini. Pewnego dnia rybka przy pomocy magicznego zaklęcia zamienia się w małą dziewczynkę. Ona i Sosuke szybko stają się parą nierozłącznych przyjaciół. Niestety, ta magiczna transformacja narusza równowagę w przyrodzie. Ojciec-mag wysyła fale oceanu na poszukiwanie córki, Księżyc niebezpiecznie zbliża się do Ziemi. Dzieci odważnie próbują zapobiec katastrofie, a jednocześnie spełnić marzenia Ponyo o byciu człowiekiem.
W 2026 roku zostaje opracowane nowe urządzenie - Augma, które jest konkurencją dla NerveGear oraz Amusphere. Jest to przenośne urządzenie, które nie posiada funkcji pełnego zanurzenia jak jego poprzednicy. Zamiast tego wykorzystuje Augmented Reality (AR). Jest to bezpieczne, łatwe w obsłudze i używa się go będąc świadomym, co jest hitem na rynku i szybko uzyskuje wielu graczy. Najpopularniejszą grą jest "Ordinal Scale" (OS), ARMMORPG opracowane tylko dla Augma. Posiada ona system rankingowy co oznacza, że aby mieć wyższe miejsce w rankingu trzeba pokonywać bossy na rajdach w mieście. Po jakimś czasie w grze pojawiają się bossy Aincardu z gry Sword Art Online. W jakim celu twórca Augmy - Profesor Tetsuhiro Shigemura dodał je do gry i kim tak naprawdę są piosenkarka Yuna, której koncert się zbliża, oraz Eiji, chłopak, który trzyma się blisko młodej wokalistki, a zarazem jest drugi w rankingu?
Minął rok od powrotu ducha Menmy do Super Peace Busters. Chociaż czas, jaki spędzili razem tego lata, był krótki, pięciu członków wspomina o tym, co się wydarzyło, pisząc list do zaginionego przyjaciela.
W niedalekiej przyszłości wszystkie maszyny świata, zasilane i kierowane przez Wielką Machinę, zwracają się przeciwko ich użytkownikom i wywołują przewrót, w którego wyniku ludzkość zostaje zdziesiątkowana. W ostatnich dniach przed katastrofą tajemniczy naukowiec powołuje do życia grupę niewielkich szmacianych laleczek, które przetrwają apokalipsę. Jedna z nich, nosząca na plecach numer 9, przejawia talenty przywódcze, dzięki czemu zbiera koło siebie grupę kilku innych lalek. Ta nietypowa miniaturowa armia pod wodzą tytułowego bohatera musi wznieść się ponad drobne spory i swoje ograniczenia, aby przechytrzyć i zwyciężyć wszechwładne maszyny, a zwłaszcza potężną bestię, grasującą na zgliszczach metropolii.
Śmiertelna plaga, znana jako "Virus Reaper", wybuchła, zabijając setki tysięcy ludzi. W desperacji brytyjski gubernator ewakuuje z zakażonego obszaru niezainfekowanych ludzi, po czym buduje ścianę, która ma odseparować skażony teren. Trzydzieści lat później ściana ciągle stoi, zaś o całym incydencie zapomniano, aż do momentu, gdy wirus atakuje ponownie. Gubernator decyduje się wysłać specjalny zespół dowodzony przez major Eden Sinclair, do skażonej strefy w celu zbadania możliwości znalezienia lekarstwa.