I sin krig mot kriminalitet jakter Batman på Riddler – en seriemorder som ser seg ut Gothams elite – da han oppdager korrupsjon i Gotham City som er knyttet til hans egen familie. Under etterforskningen må Batman skaffe seg nye allierte.

Leo, Ralph, Mikey og Donnie har alltid vært skjermet fra menneskeverdenen. Med håp om å vinne hjertene til resten av byen, og å endelig bli akseptert som vanlige tenåringer, begir skilpaddebrødrene seg ut på et heroisk eventyr. Deres nye menneskevenn, April O'Neill, bistår i jakten på et mystisk kriminalnetteverk, men når de plutselig står overfor en hel hær av mutanter, oppdager guttene at de kanskje har tatt på seg mer enn de kan håndtere.

I en futuristisk by, hvor politiet fungerer som dommer, jury og bøddel, forsøker en politiman og hans lærling å stoppe en narkotikabande fra å spre et nytt dop med virkelighetsforandrende egenskaper.

Etter at Kick-Ass' sinnsyke tapperhet inspirerer en ny bølge av selvlagde maskerte korsfarere, slår han seg sammen med en patrulje ledet av obersten "Stars and Stripes". Når disse amatør-superhltene blir jaktet på av Red Mist - gjenfødt som "The Mother Fucker" - kan bare den knivskarpe Hit-Girl forhindre deres utslettelse.

Skilpaddene hadde en erkefiende i mange år, Shredder, som de til slutt klarte å beseire. I tiden etterpå har skilpaddene vokst litt fra hverandre som familie, og deres læremester, rotten Splinter, strever med å holde dem samlet. Splinter blir bekymret når merkelige ting begynner å skje i New York, og trenger å få skilpaddene til å stå samlet for å kunne hamle opp med det som venter.