Kontynuacja jednego z największych przebojów kina animowanego ostatnich lat, w której poznamy dalsze przygody leniwca Sida, mamuta Manny’ego, tygrysa szablozębego o imieniu Diego i Scrata – wiewiórki, która przyczyniła się do nadejścia epoki lodowcowej...

Dr Robert Campbell (Sean Connery) żyje od sześciu lat w głębi amazońskiej dżungli, gdzie prowadzi badania naukowe, których celem jest znalezienie skutecznego leku na raka. Ponieważ prosił o przysłanie mu asystenta, zjawia się u niego dr Rae Crane. Campbell, który spodziewał się przyjazdu mężczyzny, traktuje ją z lekceważeniem. Ona odpłaca niechęcią. Ma jednak tę przewagę nad Campbellem, że to od niej zależy, czy będzie mógł kontynuować badania. Tymczasem biochemik przypadkowo odkrywa roślinę posiadającą zbawienną moc.

Mowgli, chłopiec wychowany przez dzikie zwierzęta, mieszka ze swoją nową rodziną w małej wiosce. Tęskni jednak za dżunglą, dawnymi przyjaciółmi i beztroską zabawą. Gdy spotyka się z ukochanym niedźwiedziem, Baloo, ucieka razem z nim do dżungli. Niestety, tam czai się ich odwieczny wróg - tygrys Shere Khan. Tymczasem bliscy Mowgliego martwią się o niego. Za chłopcem tęsknią szczególnie jego przyrodni brat Ranjan i przyjaciółka Shanti, którzy w końcu wyruszają do dżungli, by go odnaleźć.

Mijają lata, od kiedy Tarzan, opuścił afrykańską dżunglę na rzecz cywilizowanego życia w Londynie. Jako John Clayton III, Lord Greystoke decyduje się wrócić do Konga, gdzie ma pełnić funkcję emisariusza rządu z misją handlową. Nie zdaje sobie jednak sprawy z tego, że jest pionkiem w śmiertelnie niebezpiecznej grze targanego wolą zemsty, chciwego kapitana Leona Roma z Belgii. Okazuje się, że osoby stojące za zabójczym spiskiem nie mają pojęcia, co rozpęta się za ich sprawą.

Do kolumbijskiej dżungli wyrusza trzech naukowców. Pragną oni udowodnić zanik skłonności kanibalistycznych wśród żyjącej tam ludności. Przypadkowo spotykają tam dwoje ludzi - jak się później okazuje są oni handlarzami narkotyków z Nowego Yorku, którzy w bestialski sposób zabili parę zamieszkujących w dżungli Indian. Wkrótce wszyscy członkowie ekspedycji - wraz z handlarzami - zostają uwięzieni w wiosce przez kanibali, którzy od tej pory znęcają się nad nimi za śmierć swoich współplemieńców

Ukrywający się pod maską Fantom, którego prawdziwe nazwisko brzmi Kit Walker, wykorzystuje nadprzyrodzone zdolności do walki ze złem. Bohater musi zmierzyć się z miliarderem Xanderem Draxem. Bogacz za wszelką cenę usiłuje zdobyć trzy czaszki, których moc ma mu pomóc w przejęciu panowania nad światem. Wie, że jedna z nich znajduje się w bengalskiej dżungli, dlatego wysyła tam swego zaufanego człowieka, Quilla. Podążając tropem Draxa, Fantom spotyka dziennikarkę Dianę Palmer.