Bruņurupuči Maikijs, Donijs, Leo un Rafs atgriežas uz lielā ekrāna animācijas piedzīvojumu filmā! Gadiem ilgi dzīvojuši slepenībā no cilvēku pasaules, brāļi nolemj iekarot ņujorkiešu sirdis, cerībā, ka paveicot ko īsteni varonīgu, cilvēki viņus pieņems kā parastus pusaudžus. Nejaušība viņus saved kopā ar Eiprilu, kura palīdz viņiem iesaistīties cīņā ar noslēpumainu noziedzīgo sindikātu. Drīz viņi attopas notikumu virpulī, kad viņiem pretī stājas mutantu armija, un mutantu haoss var sākties!
Mikelandželo, Donatello, Leonardo un Rafaels atgriežas uz lielā ekrāna! Superļaundaris Šreders ir izbēdzis no aresta un metas uz vienu roku ar ķerto zinātnieku Baksteru Stokmanu, lai īstenotu savu velnišķīgo pasaules pārņemšanas plānu. Kamēr bruņurupuči cīnās, lai Šredera plāns neizdotos, viņiem uzrodas vēl viens, lielāks ienaidnieks ar pasaules iekarošanas plāniem – bēdīgi slavenais Krangs.