Amnezija je spasila posada talijanskog ribarskog broda kad pluta na moru. Nema identitet i prošlost, ali posjeduje niz izvanrednih talenata u lingvističkim, borilačkim i samoobrambenim umijećima koji sugeriraju profesiju rizika. Zbunjen i dezorijentiran, on poduzima besnu potragu da otkrije tko je i zašto je njegov život preuzeo tako opasan zaokret.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.
Graham Hess je protestantski pastor koji živi sa svoje dvoje djece i svojim bratom Merrill, bivšom bejzbol zvijezdom koja radi na benzinskoj postaji. Nakon smrti svoje supruge u prometnoj nesreći, Graham gubi vjeru i posljedično odustaje od svojih župljana. Jednog jutra kada se probudi i otkriva da su njegova djeca otkrila hladno otkriće na poljima kukuruza koja okružuju njegovu farmu.
Kapetan Greetham (E. Fox) i admiral Hood (L. Olivier) ispituju kapetana Williama Bligha (A. Hopkins) na suđenju u kojem on pokušava objasniti koji su događaji doveli do gubitka komande na brodu 'Bounty'. Kapetan Bligh okupio je posadu i krenuo na putovanje brodom prema Tahitiju kako bi donio mladice hljebovca. Na brodu je i njegov prijatelj, mlad i ambiciozan Christian Fletcher (Mel Gibson). Kako bi dobio na vremenu, Bligh odluči oploviti oko Rta Horna, rutom koja je nesigurna i nepoznata. Posada jedva preživi taj pothvat, što samo povećava napetost i nezadovoljstvo zbog Blighovog izuzetno okrutnog nametanja discipline. Kad napokon stignu na otok, rajska atmosfera briše sjećanje na sve sukobe i probleme. Fletcher se zaljubi i upušta u strastvenu ljubavnu vezu s tahićanskom princezom, što još više uništava disciplinu i razara prijateljstvo između njega i kapetana Bligha.