SEELE järjestää täysimittaisen hyökkäyksen NERViä vastaan tarkoituksenaan tuhota EVAt ennen kuin Gendo käynnistää Kolmannen iskun ja Ihmiskehitysprojektin.
Nopean mutta tuhoisan sodan jälkeen runnellun maapallon resurssit ovat käyneet vähiin. Ihmiset ovat nostaneet kaupunkinsa pyörille tai telaketjuille vaeltaakseen luonnonvarojen perässä tai saalistaakseen muita kaupunkeja omien toimintojensa pyörittämiseksi. Tekninen kehitys on pysähtynyt, ja sotaa edeltävän aikakauden teknologia on suuressa huudossa. Historiallisia esineitä tutkiva nuori Tom sekaantuu pienempiä kaupunkeja ahmivan, valtavilla telaketjuilla kulkevan Lontoon kulissien takaisiin valta- ja kostokähinöihin. Kun hän pelastaa korkean virkamiehen hengen kaupunkiin soluttautuneen Hesterin murhayritykseltä, palkkiona onkin yllättäen sinkauttaminen ulos kaupungista murhaa yrittäneen nuoren naisen perässä. Metrien syvyisissä telaketjujäljissä kompuroiden Tom ja Hester lähtevät Lontoon perään kummankin halutessa omista syistään takaisin suurkaupungin kyytiin.
Kuusitoistavuotias Leila herää joka aamu myöhään, mutta tänään kukaan ei herätä häntä. Missä ovat hänen vanhempansa? Koko naapurusto on tyhjä, kaikki ovat kadonneet. Lopulta hän tapaa neljä muuta nuorta: Dodjin, Yvanin, Camillen ja Terryn. Yhdessä heidän täytyy yrittää selviytyä ja selvittää, mitä on tapahtunut. Mutta ovatko he todella yksin?