Kuus kuud peale tapva "raevuviiruse" levikut annab USA armee teada, et olukord on saadud kontrolli alla ja edasine oht puudub. Inimesi hakatakse tagasi Londonisse laskma, kuid peagi selgub, et linna on pääsenud ka keegi nakatunu. Tuleb välja, et viirus elab edasi, olles tapvam kui kunagi varem.
Raccoon City elanikkonnast on vabastatud surmav viirus. Alice (Milla Jovovitš), üks biokeemilises katastroofis ellujäänutest, asub selle laastatud linna südames. Pärast tema geneetikat muutnud eksperimente on tal nüüd üliinimlikku jõudu, meeli ja osavust. Need ja muud oskused on need, mida peab kasutama see, kes soovib selles uues seikluses ellu jääda. Koos teiste ellujäänutega peab ta põgenema üha ohtlikuma Raccoon City eest. Oma eesmärgi saavutamiseks peavad nad võitlema Umbrella Corporationi jõudude, nende laborites loodud vägivaldsete biotehniliste olendite, linna vaevavate zombidega ja lõpuks nende loomingu kõige kolossaalsema ja surmavamaga: Nemesis.