Billy Costigan er en fersk politimann som har vokst opp omgitt av kriminalitet. Det gjør ham til den perfekte muldvarp, og han settes til å infiltrere mafiaen, hvor Frank Costello er boss. Billys oppgave er å vinne Costellos tillit og dermed hjelpe etterforskerne Dignam og Queenan med å ta mafiabossen. I mellomtiden vinner spesialetterforsker Colin Sullivan alles tillit på politihuset. Ingen forstår at han er Costellos muldvarp.
Det skjer over 300 bankran i Boston hvert år. Og de fleste ranerne bor i det 2,5 kvadratkilometer store nabolaget Charlestown. En av dem er Doug MacRay, men han er annerledes enn sine "kolleger". Doug hadde nemlig sjansen til å gjøre suksess, til å unngå å traske i de kriminelle fotsporene til faren sin. Isteden er han blitt lederen for en gjeng brutale bankranere, som setter sin ære i å ta det de skal ha og forsvinne uten spor.