Bogata pripadnica zlatne mladeži iz San Francisca dovodi potencijalnoga dečka u sjeverni kalifornijski gradić Bodega Bay, no stvari postaju čudne kada odjednom jato ptica, čiji se broj povećava, počne napadati ljude.
Stigavši kao turisti u francuski Maroko, američki kirurg Ben MacKenna, njegova supruga Jo i desetgodišnji sin Hank, već u autobusu za Marakesh upoznaju simpatičnoga Francuza Louisa Bernarda. Samo dvadeset i četiri sata kasnije, njihov novi poznanik umre na liječnikovim rukama proboden nožem na prepunom arapskom bazaru. Ubrzo nestaje mali Hank, a otmičari poručuju da će ostati na životu samo ako MacKenna nikome ne oda tajnu koju mu je prošaptao umirući. Očajni otac, znajući da se ne smije obratiti policiji, pretvara se u istražitelja. Put ga vodi u London...
Na temelju posrednih dokaza, nedužni Londonac uhićen je zbog zločina serijskog silovatelja koji davi svoje žrtve.
Zbliživši se s Trinity, Neo je u njoj pronašao ženu svog života, ali ga muče tjeskobni snovi o djevojčinoj pogibiji. Istodobno, neuništivi agent Smith, udarna snaga Matrice kreirana za uklanjanje mogućih pogrešaka sustava, postaje sve moćniji i stječe sposobnost umnogostručivanja. Zionom, posljednjim uporištem ljudskog otpora strojevima smještenom duboko pod površinom Zemlje, vlada vijeće kancelara među kojima u Nea najviše vjeruje iskusni Hamann. Prilikom još jednog razgovora s Oracle, tijekom kojeg posumnja da je i ona dio Matrice, Neo dozna da što prije mora pronaći Ključara, čovjeka uz čiju pomoć bi mogao doprijeti do samog Arhitekta, stvoritelja Matrice. No da bi pronašao Ključara, Neo se mora susresti s podlim Merovingianom, šefom podzemlja i ljubavnikom lijepe Persephone...
Seth Gecko i njegov mlađi brat Richard u bijegu su nakon krvave pljačke banke u Teksasu. Pobjegnu preko granice u Meksiko i bit će slobodni sljedećeg jutra, kada isplate dug lokalnom kralju. Samo moraju preživjeti 'od sumraka do zore' na mjestu susreta, koje se ispostavilo kao pakleni striptiz.
Spašavajući smrtno ranjenu Trinity i boreći se protiv agenta Smitha, okretni Neo, Odabrani kojem je proročica Oracle predvidjela ključnu ulogu u oslobađanju ljudi od vlasti parazitskih strojeva, i sam je teško ranjen pao u komu. Dok on na virtualnoj postaji podzemne željeznice mora odabrati između života i smrti, u čemu bi mu mogli pomoći inženjer Rama-Kandra, otac djevojčice Sati, i zagonetni Skretničar, Morpheus, Trinity i Dječak suprotstavljaju se zlom Merovingianu. Kad se vrati među žive, Neo shvati da se mora vratiti izvoru i spoznati sama sebe, jer agent Smith svakim trenutkom postaje sve snažniji i opasniji. O ishodu njihova sukoba ovisi budućnost čovječanstva i pobjeda nad Matricom. U međuvremenu, strojevi se približavaju Zionu, a u obrani kolonije sudjeluje i odvažna Zee, supruga Neova suborca Linka. Istodobno, izdajnik Bane ubojstvom liječnice pokaže svoje pravo lice...
Sy Parrish (Robin Williams) fotografijom se bavi već 20 godina i svoje golemo znanje koristi razvijajući ih u malenom studiju. Osim svoga posla, Sy nema ništa i živi usamljenim životom. Počinje razvijati opsesiju obitelji Yorkin, najvjernijim mušterijama, čije je fotografije počeo razvijati još kad je njihov sin tinejdžer bio beba. Sy želi postati dio njihova života, ali postepeno otkriva kako je skladna obiteljska fasada tek pomno građena krinka. Otkrivši zastrašujuću tajnu Willa Yorkina (Michael Vartan), Sy kreće u akciju koja bi mogla unesrećiti mnoge uključene.
Nakon što joj oca i majku ubiju paklenska bića Cenobiti, mladoj Kirsty Cotton (A. Lawrence) nitko ne vjeruje te je poslana na liječenje u psihijatrijsku kliniku. Kliniku vodi neobičan, tajanstveni ali i briljantni psihijatar, dr. Channard (K. Cranham), koji zapravo godinama potajno traži ključ kako bi prodro u drugu dimenziju. Stoga on itekako vjeruje Kirstynim pričama i po njezinim uputama oživi lijepu i zlu Kirstynu maćehu Juliju (C. Higgins). Ona se vraća bez kože, koja će joj narasti tek nakon nekog vremena i upućuje doktora u tajne onozemnog. No one nisu tako bezazlene kao što se na prvi pogled čini. U Kirstynu priču je uvjeren i mladi Channardov asistent Kyle MacRae (W. Hope) koji joj svim srcem pokušava pomoći, no i on postane žrtva paklenske Julije. Kirsty je ipak uporna u namjeri da uništi Cenobite, a u tome joj je velika pomoć nijema, autistična djevojčica Tiffany (I. Boorman), uma naprosto stvorena za rješavanje zagonetki, pa tako i one o tajanstvenoj kutiji...
Tijekom putovanja iz Teksasa u Meksiko, skupina mladih ljudi pokupila je krvavog autostopera koji tvrdi da je jedini preživjeli masakr koji se dogodio noć prije u obližnjoj kući. Remeke istoimenog klasika Tobea Hoopera (1974).