1930-luvulle sijoittuva elokuva kertoo ryhmästä tutkimusmatkailijoita ja dokumentaristeja, jotka matkustavat Sumatran lähelle salaperäiselle Pääkallo-saarelle tutkimaan jättimäisen Kong-gorillan legendaa. Perille päästyään he huomaavat, että King Kong on todellinen olento, joka elää valtavassa viidakossa. Seurueen etsiessä suurta apinaa, he joutuvat taistelemaan sekä Kongia että Kongin vihollisia dinosauruksia vastaan. Kongin huomion kiinnittyessä kauniiseen naiseen (Naomi Watts), se rauhoittuu ja joutuu vangiksi. Seurue kuljettaa Kongin New Yorkiin, missä sen ankea tulevaisuus on olla ihmisten tuijoteltavana... Mutta kuinka kauan ihmisen vallan kahleet pystyvät pitämään otteessaan jättiläisapinaa?
Sade piiskaa öistä valtamerta. Laivoja vajoaa meren syvyyksiin. Panaman metsistä ja Jamaican rannikolta löytyy tuhoisan olennon jalanjälkiä. Otus tallustaa kohti USA:ta, ja biologi Niko Tatopoulos kutsutaan hätiin. Hän saa selville, että radioaktiivinen laskeutuma on luonut jättiläishirviön, jolle ihmisen aseet ovat pelkkää hyttysen ininää. Ja louskuleuka lähestyy jo uhkaavasti New Yorkia...