Oli aurinkoinen aamupäivä 22.11.1963 Texasissa. Presidentti John F. Kennedy ajoi avoautossa halki Dallasin ja kaupunkilaiset tungeksivat katsomaan - arvaamatta että he näkisivät presidentin elossa enää hetken. Leppoisa juhlinta katkeaisi kohta laukauksiin, joista kiisteltäisiin vuosikymmeniä. Lähtivätkö luodit Lee Harvey Oswaldin aseesta vai oliko kaiken takana jotain muuta...
Jason Bourne pelastetaan merestä keho täynnä luodinreikiä. Herättyään hän ei muista nimeään eikä mitään menneisyydestään. Hänen reaktionsa ovat kuitenkin salamannopeita ja tappavia. Eräänä päivänä hänet tunnistetaan ja helvetti pääsee valloilleen. Pian hänellä onkin murhanhimoiset takaa-ajajat perässään ja hänen on selvitettävä henkilöllisyytensä pelastaakseen henkensä.
Jason Bourne haluaa vain kadota. Sen sijaan, juuri ne ihmiset jotka hänet alun perin kouluttivat jahtaavat häntä nyt. Muistinsa ja rakkaansa menettäneenä Bourne ei pelkää luotien suhinaa tai uuden sukupolven koulutettuja tappajia. Hänellä on vain yksi päämäärä: Mennä takaisin alkuun ja selvittää kuka hän on.
Muistinmenetyksestä kärsivä Bourne on jättänyt väkivaltaisen menneisyyden taakseen ja elää tavallista elämää Marie-tyttöystävänsä kanssa. Suunnitelmat rauhallisesta elämästä romuttuvat, kun hän joutuu salamurhayrityksen kohteeksi. Tuntemattoman vihollisen jahtaama Bourne todistaa, ettei hän ole helppo kohde ja ettei hänen taitojaan ja sitkeyttään kannata aliarvioida.
IMF-ryhmä (Impossible Mission Force) saa tehtäväkseen estää CIA-agenttien nimiä sisältävän NOC-listan joutumisen erään asekauppiaan käsiin. Ethan Huntin johdolla ryhmä lähtee Prahaan kaappaamaan disketin. Vaikka tehtävä näyttääkin aluksi sujuvan suunnitelmien mukaan, ryhmä huomaa pian, että he ovat kävelleet suoraan ansaan. Tehtävä keskeytetään ja ainoat, jotka ovat jääneet henkiin, ovat Ethan ja Claire. Epäilyt petturuudesta nousevat esille, joten Ethan lähtee omalle tehtävälleen. Hän aikoo löytää kadonneen NOC-listan ja paljastaa petturin.
Marraskuun 22. päivänä 1963 kaikki olisi voinut olla toisin. Salaisen palvelun agentti Frank Horrigania ahdistaa Kennedyn murha. Presidentin lähimpänä miehenä hänen olisi pitänyt reagoida nopeammin. Vielä kolmekymmentä vuotta myöhemmin tuon kohtalokkaan luodin aiheuttamat painajaiset eivät jätä häntä rauhaan. Ammattitappaja Leary tietää Horriganin heikon kohdan. Hän on päättänyt murhata nykyisen presidentin kuuden viikon sisällä – uhkauksensa hän paljastaa Frankille puhelinsoitoilla, joita FBI yrittää kuumeisesti jäljittää. Presidentin suojelu on edelleen Horriganin harteilla, eikä hän aio toistaa virhettään.
Alamäessä oleva dekkari ja skandaalissa ryvettynyt futistähti liittoutuvat pahojen poikien pään menoksi. Voimakaksikko väistelee liukkaasti luoteja, heittää häijyä läppää ja tylyttää tottuneesti konnia. Kova kovaa vastaan ei ole koskaan ollut näin kaunista.
Tom Cruise tekee komean paluun Ethan Huntin rooliin toimintaseikkailujen sarjan kolmannessa osassa, jonka on ohjannut Lost-sarjan luoja J.J.Abrams. Nyt Hunt joutuu kohtaamaan kaikkien aikojen pahimman vastustajansa, häikäilemättömän asekauppiaan Owen Davianin (Philip Seymour Hoffman). Huima seikkailu kuljettaa pelottoman sankarin tiimeineen Yhdysvalloista Vatikaaniin, Berliiniin ja Shanghaihin.
CIA-analysoijan työnsä jättänyt Jack Ryan lomailee Lontoossa perheensä kanssa, kun hän osuu sattumalta keskelle IRA:n salamurhayritystä. Ryan pelastaa terroristien kohteen hengen ja aiheuttaa samalla yhden hyökkääjän kuoleman. Kotimaahan palattuaan Ryan saa huomata, että IRA ei ole unohtanut hänen tekoaan, ja koko perheen on lähdettävä pakomatkalle kostoa vannovan terroristin tieltä.
Kun Jack Ryan nimitetään CIA:n virkaa tekeväksi tiedustelupäälliköksi, on hänen ensimmäinen tehtävänsä selvittää presidentin läheisen ystävän murha. Uhri on suurliikemies, jolla on yhteyksiä Kolumbian huumekartelleihin. Ryanin tietämättä CIA on jo lähettänyt Kolumbiaan vaarallisen kenttäagentin, joka johtaa puolisotilaallista joukko-osastoa tuhotakseen kolumbialaiset huumekuninkaat.
Rollie Tyler (Brown) on erikoistehosteiden huippuosaaja. Tällä kertaa hänen taitojaan tarvitsee viihdemaailman sijaan oikeuslaitos, kun Tyler saa tehtäväkseen lavastaa alamaailman todistajan murhan. Kun työ on tehty ja ilmiantaja on saatu katoamaan, Tyler tajuaa kauhukseen, että murhaa ollaan vierittämässä hänen niskoilleen. Toimeksiantajiensa jahtaama ja petetty Tyler ymmärtää pian, ettei hän voi luottaa kehenkään ja että kiperästä paikasta hänet voi pelastaa vain ennennäkemättömän illuusion järjestäminen.
Maggie on yhteiskunnan pahin painajainen: rähjäinen, hurja, syrjäytynyt huumehörhö. Hän odottaa kuolemantuomionsa täytäntöönpanoa, mutta korkean tason salamurhiin erikoistunut hallituksen osasto tahtoo muuttaa Maggien arvaamattomasta ohjuksesta tehokkaaksi tappokoneeksi. Maggie joko oppii tappamaan käskystä tai kuolee oikeuden määräyksestä. Viehättävällä, vaarallisella Maggiellä on edessään pelottava tulevaisuus, jossa sekä rakkaudella että raakuudella on sijansa maailmassa ja hänen sielussaan.
Palkkamurha laukaisee monimutkaisen tapahtumien ketjun, joka koskettaa monen ihmisen elämää. Mukana on rosvoja ja poliiseja, itsemurhaa hautova elokuvaohjaaja ja ylimielinen taidekauppias sihteereineen sekä kaksi kaunista ja mustasukkaista naista.
Chicagolaispoliisi Nico Toscani on saanut vihiä suuresta jutusta. Liian suuresta; huumeratsiassa napatut roistot pääsevät vapaalle jalalle ja Nico itse onkin äkkiä entinen poliisi. Mutta Nicolla on tähtäimessään entisiä CIA-agentteja, jotka pyörittävät huumekauppaa ja suunnittelevat poliittista salamurhaa.
Maapallo on jälleen kiristyksen kohteena. IMF-agentti Ethan Huntin täytyy uuden tiiminsä kanssa etsiä rikolliseksi kääntynyt ex-agentti Sean Ambrose, jolla on hallussa erittäin vaarallinen Chimera-virus, jolla hän voisi tappaa miljoonia ihmisiä. Virologi Nekhorvich on labrassaan kehittänyt tämän hirviömäisen tappajaviruksen pyrkiessään löytämään lääkkeen influenssaan. Toki mies on keksinyt myös vastalääkkeen, Bellerofonin, jota myös Ambrose tavoittelee isojen seteleiden toivossa. Hunt saa avukseen Nyah Hallin ja Lutherin lisäksi Ambrosen entisen tyttöystävän, jonka Hunt onnistuneesti värvää mukaan estämään Ambrosen aikeet. Tavallista kimurantimmaksi tehtävän tekevät sankarin tunteet kaunista ammattivarasta Hallia kohtaan: tyttö kun pitäisi soluttaa vihollisen petiin vakoilemaan. Apunaan Huntilla on taas vihoviimeisin hyperteknologia, mutta pahikset on varustettu samanmoisin vehkein, ja pian ovat hengenvaarassa paitsi tyttö, myös koko Australian pahaa-aavistamaton väestö.
Jack Foster on entinen CIA:n agentti. Pelastaakseen tyttärensä ja estääkseen tappavan viruksen päätymistä vihollisen käsiin Jackin on sukellettava syvälle kansainvälistä vakoilun vaaralliseen maailmaan. Epäluotettavat CIA:n agentit salakuljettavat tappavan viruksen USA:han ja käyttävät Jackia kuriirinaan. Tajuamatta, millaiseen juoneen hänet on sotkettu, Jack vie tyttärensä matkalle Eurooppaan, jossa salaperäinen ulkomaalainen agentti kidnappaa tytön. Pelastaakseen tyttärensä ja tuhotakseen kidnappaajat Jackin on taisteltava tiensä vakoiluverkostoon, jossa viholliset vaanivat varjoissa ja ystävät osoittautuvat vihollisiksi!