Film Drvo života je prije svega himna životu, koja otkriva odgovore na pitanja koja proganjaju čovjeka, kroz kaleidoskop intimnog i kozmičkog, od sirovih emocija teksaške obitelji do divljih i beskonačnih rubova prostora i vremena, od dječaka koji gubi nevinost do čovjeka koji spoznaje strahopoštovanje, čuđenje i transcendenciju.
Priča smještena u 1898. prati britanskog časnika Harryja Favershama koji napusti položaj kada sazna da njegova pukovnija namjerava krenuti u Sudan u rat protiv „muslimanskih fanatika“. Njegovi prijatelji i zaručnica pošalju mu četiri bijela pera, simbol kukavičluka. Kako bi spasio svoju čast, Faversham se preruši u Arapina te otputuje u Sudan kako bi se ubacio iza neprijateljskih linija te poslužio britanskim snagama kao uhoda i izvidnik. Kada napadnu njegovu bivšu pukovniju, Faversham u tajnosti spasi živote onih koji su ga proglasili kukavicom.