Dr. Indiana Jones (Harrison Ford) jest archeologiem, który łączy wykłady uniwersyteckie z ekspedycjami badawczymi. Właśnie powrócił z ostatniej, w trakcie której odniósł porażkę w rywalizacji z naukowcem pracującym dla nazistów. Nie dane jest mu zająć się nauczaniem. Otrzymuje bowiem tajne zadanie od służb specjalnych. Wyrusza do Egiptu, gdzie prawdopodobnie odkryto miejsce przechowywania Arki Przymierza. Nie może dopuścić, by święte trofeum znalazło się w rękach Niemców. Pomoże mu w tym jego dawna dziewczyna, Marion (Karen Allen).

Animowany film przygodowy z wytwórni Walta Disneya. Milo, młody, roztargniony pracownik kotłowni słynnego muzeum marzy o rola wielkiego podróżnika jakim był jego dziadek. Wierzy, że legenda o zaginionej Atlantydzie jest prawdziwa i nawet udaje mu się odkryć miejsce w którym powinna się znajdować. Jednak muzeum nie jest skłonne sfinansować wyprawę. Niespodziewanie zgłasza się do niego bogaty, dawny przyjaciel jego dziadka gotów sponsorować poszukiwania. W głębiny oceanu Atlantyckiego wyrusza ekipa łodzi podwodnych na pokładzie ze specjalistami różnych profesji, których zamiary nie zawsze będą pokrywały się z planami Milo...