Scooby Doo razem z grupą przyjaciół wyruszają na spotkanie nowej przygody, którą tym razem okazuje się wyprawa do szkoły upiorów, gdzie uczniami są potomkowie przerażających potworów.

Podczas seansu hipnozy doktor Almada odkrywa, że jego narzeczona Flor jest reinkarnacją azteckiej dziewicy Xochitl, skazanej na śmierć za miłość do wojownika Popoca. Jej ciało złożono w Wielkiej Piramidzie w Jukatanie, gdzie spoczywają również starożytne skarby. Wejścia do grobowca strzeże zmumifikowany kochanek dziewczyny. Flor prowadzi Almadę, asystenta Pincate oraz swojego ojca do szczątek Xochitl. Okazuje się, że złoty medalion z mapą został skradziony przez Popoca i znajduje się w Meksyku. Grupa rusza w pościg, a za nimi znajomy Almady, profesor Krup z gangiem bandytów...

Kyle, Dustin, Felicia, Jay, Serena i Amy są studentami archeologii, którzy podczas prac wykopaliskowych budzą gniew Ozyrysa. Teraz muszą zmierzyć się z jego armią, która wyrusza na podbój świata.