O cão mais medroso do mundo está de volta envolvido na investigação dos maiores mistérios. Aqui são quatro mistérios escolhidos pelos próprios fãs. Podemos ver o cão e sua turma investigando o caso envolvendo o fantasma do assustador Capitão Cutler em Uma Pista Para Scooby-Doo. Depois, ele a turma da Mistério S.A. tentam desvendar o que teria acontecido com a tripulação de uma embarcação desaparecida em Mistério em Alto-mar. Já em Quem É o Ladrão? eles descobrem o paradeiro de um perigoso ladrão de bancos. Para encerrar, os veja subirem ao palco para acabarem com a graça de acrobatas meio malucos em Um Salto Para o Mistério.

Durante uma viagem a Hollywood, a turma decide visitar o lendário e histórico estúdio Brickton. Ao chegar lá, a Mistério S/A descobre que o estúdio está prestes a ser fechado e vendido para empresários que querem demoli-lo. Para piorar ainda mais a situação, o local está sendo assombrado pelo fantasma de Boris Karnak, um famoso ator de filmes antigos, que aterroriza o estúdio utilizando de personagens que marcaram sua carreira, como: a Múmia, o Zumbi e o Cavaleiro Sem-Cabeça. O fantasma espantou todo o elenco e equipe do filme que poderia salvar o estúdio, agora, resta a turma descobrir o que está realmente acontecendo e impedir que o estúdio seja fechado.

O primeiro filme completo de animação chega aos grandes ecrãs com histórias nunca contadas das origens de Scooby-Doo e um dos maiores mistérios da carreira de Mystery Inc.. Vamos ver como Shaggy e Scooby se conheceram e como foram apresentados aos jovens detectives Fred, Velma e Daphne para formarem a Mystery Inc.. Agora o grupo tem o seu maior desafio, que envolve um enredo para libertar o cão fantasma Cerberus no mundo.

Junte-se a Scooby-Doo, Salsicha e à turma da Mistério S/A, que ganharam uma viagem incrível e decidiram tentar deixar os dias de resolução de mistérios para trás. Mas assim que chegam à ilha tropical, Velma, Daphne e Fred logo percebem que o lugar é estranhamente familiar a uma viagem assustadora que fizeram décadas atrás. Não vai demorar muito para eles descobrirem que esse paraíso tropical tem um preço, pois um exército de zumbis saqueadores os esperam! Embarque e viaje com Scooby-Doo e sua turma enquanto eles desvendam os mistérios da Ilha Zumbi nesse filme de aventura original.