Zgodovinski ep o jezuitih v Južni Ameriki v obdobju kolonializma ob spremljavi mogočne glasbe Ennia Morriconeja. Južna Amerika v 18. stoletju. Dve veliki kolonialni sili tekmujeta za prevzgojo avtohtonih prebivalcev. Bivši trgovec s sužnji Rodrigo Mendoza (De Niro) se v iskanju odrešitve po uboju brata pridruži jezuitski skupini, ki jo vodi oče Gabriel (Irons). Mendoza in Gabriel se znajdeta na različnih bregovih glede vprašanja, kako ubraniti misijo: prvi je za oborožen boj proti kolonialistom, drugi verjame v moč molitve in pasivnega odpora.

Zgodba se dogaja globoko v osrčju pragozda, kjer raste zelo redka rdeča orhideja, iz katere bi lahko naredili serum, ki pomlajuje in podaljšuje življenje. Skupina znanstvenikov se šele kasneje zave, da naloga dobiti to rdečo orhidejo, ki marsikomu lahko prinese tudi znaten kupček denarja, ne bo tako lahka. Orhidejo namreč čuva predator - anakonda, ki nikomur ne pusti na svoje ozemlje...