Η Γαλαξιακή Αυτοκρατορία με αρχηγό τον Νταρθ Βέιντερ, καταδιώκει τον Λουκ Σκαϊγουόκερ και την Επαναστατική Συμμαχία. Κι ενώ ο Βέιντερ κυνηγά τους φίλους του Λουκ, ανάμεσά τους και τους Χαν Σόλο, Πριγκίπισσα Λέια Οργκάν, αυτός μελετά την Δύναμη με τον Δάσκαλο Τζεντάι Γιόντα. Όταν όμως ο Βέιντερ αιχμαλωτίσει τους φίλους του Λουκ, ο Σκαϊγουόκερ πρέπει ν' αποφασίσει αν θα ολοκληρώσει την εκπαίδευση του και να γίνει Τζεντάι ή αν θα πρέπει ν` αντιμετωπίσει τον Βέιντερ και να σώσει τους συντρόφους του.
Επτά αστρovαύτες -πέvτε άvδρες και δυo γυvαίκες- πoυ απoτελoύv τo πλήρωμα τoυ γιγαvτιαίoυ "Νoστρόμo", έχoυv αvαλάβει vα μεταφέρoυv πoλύτιμα μεταλλεύματα και πρώτες ύλες από τo Διάστημα. Κατά τη διάρκεια, όμως, της επιστρoφής τoυς στη Γη, θ' αvακαλύψoυv ότι στo φoρτίo πoυ μεταφέρoυv υπάρχει έvας μυστηριώδης απειλητικός επισκέπτης. Τρoμoκρατημέvoι θα πρoσπαθήσoυv v' αvτιμετωπίσoυv και vα εξoυδετερώσoυv αυτό τov άγvωστo εχθρό σ' έvα επικίvδυvo παιχvίδι επιβίωσης.
Μετά την ανακάλυψη στη Σελήνη ενός μυστήριου, μαύρου μονόλιθου, που ίσως κρύβει πολλές απαντήσεις γύρω από την καταγωγή της ανθρωπότητας, ξεκινά ένα ταξίδι αναζήτησης προς το άγνωστο, ένα διαστημικό ταξίδι στον πλανήτη Δία. Αρχηγός της ομάδας, που συγκροτείται, είναι ο Ντέιβ, καθοδηγούμενος από έναν ηλεκτρονικό υπολογιστή τεχνητής νοημοσύνης, τον ΧΑΛ. Όμως ο ΧΑΛ, που ρυθμίζει τις λειτουργίες του σκάφους, θα παρουσιάσει ξαφνικά παράξενες διαταραχές και θα στραφεί ενάντια στους ίδιους τους κοσμοναύτες.
Ο Νταρθ Βέιντερ και ο αυτοκράτορας συνωμοτούν για να φέρουν τον Λουκ Σκαϊγουόκερ στη σκοτεινή πλευρά ενώ οι δυο τους κατασκευάζουν ένα καινούριο, άφθαρτο Αστρο του Θανάτου. Ο Λουκ όμως μαζί με την πριγκίπισσα Λέια Οργκάνα ταξιδεύουν στον πλανήτη Τατούιν για να σώσουν τον Χαν Σόλο από τον Jabba the Hutt.
Ο Καν, ένας γήινος που κατάφερε να επιβιώσει δύο αιώνες στον πλανήτη Σέτι Αλφα 5, συλλαμβάνει τον Τσέχοφ, από τον οποίο μαθαίνει για το απόρρητο σχέδιο "Γένεσις". Επιτίθεται στο διαστημικό εργαστήριο και παρασύρει εκεί τον Κερκ και το πλήρωμα του Εντερπράιζ.
Ο Anakin Skywalker χάνοντας την εμπιστοσύνη του στην τάξη των Jedi, στρέφεται στην Σκοτεινή Πλευρά της Δύναμης, με την ελπίδα ότι έτσι θα βρει τον τρόπο να σώσει την Padme από τον θάνατό της, τον οποίον προαισθάνεται και να κερδίσει την αναγνώριση που αξίζει. Η απόφασή του αυτή θα επηρεάσει την ισορροπία στην Δύναμη και θα αλλάξει την όψη του πολύ, πολύ μακρινού γαλαξία για πάντα...
Οι Μποργκ έχουν επιστρέψει. Ο Κάπτεν Πικάρντ που ηγείται του Εντερπράιζ αποφασίζει να αγνοήσει τις διαταγές της συμμαχίας και να αντιμετωπίσει τους Μποργκ. Με τις γνώσεις που έχει το πλήρωμα καταφέρνει να κερδίσει, αλλά ένας μικρός αριθμός Μποργκ γλιτώνει. Καθώς το Εντερπράιζ τους καταδιώκει, μπαίνει σε μια χρονοδίνη δημιουργημένη από τους Μποργκ. Τώρα βρίσκονται ξαφνικά στον 21ο αιώνα…
Μια μυστήρια εξωγήινη δύναμη απειλεί τη Γη εξατμίζοντας το νερό των θαλασσών και καταστρέφοντας την ατμόσφαιρα. Για να σώσουν την ανθρωπότητα ο Κάπτεν Κερκ και το πλήρωμα πρέπει να γυρίσουν πίσω στη γη του 1986 για να βρουν το μόνο πλάσμα που μπορεί να σταματήσει το κακό…
Έχοντας προβλήματα με την ατμόσφαιρα του πλανήτη τους, οι Κλίνγκον αποφασίζουν να ενωθούν με την Ομοσπονδία, τερματίζοντας έτσι τον πολυετή πόλεμο. Το Εντερπράιζ αναλαμβάνει να συνοδεύσει το σκάφος τους στη Γη. Όμως, καθ΄ οδόν, ο Κανγκελάριος των Κλίνγκον δολοφονείται. Ο Κερκ και ο δόκτορ ΜακΚόι συλλαμβάνονται και φυλακίζονται στον παγωμένο πλανήτη Ρούρα Πέντε.
Οι Ιππότες Τζεντάι Όμπι-Ουάν Κενόμπι και Κουάι-Γκον Τζιν σώζουν την Αμιντάλα, βασίλισσα ενός ειρηνικού πλανήτη όπου έχουν εισβάλει σκοτεινές δυνάμεις, και ανακαλύπτουν τον 9χρονο Άνακιν Σκαϊγουόκερ, ένα παιδί πολύ ισχυρό στη Δύναμη.
Δέκα χρόνια μετά τα γεγονότα της Αόρατης Απειλής, ο Άνακιν Σκάιγουοκερ ζει ένα απαγορευμένο ειδύλλιο με την Πάντμε Αμιντάλα, ενώ ο Όμπι-Ουάν Κενόμπι ερευνά μια απόπειρα δολοφονίας εναντίον της γερουσιαστού Πάντμε και ανακαλύπτει έναν μυστικό στρατό κλώνων που έχει κατασκευαστεί για τους Τζεντάι.
Αφού το Εντερπράιζ επισκευάζεται, το νέο πως το σκάφος θα παροπλιστεί σοκάρει το πλήρωμα. Ακόμα χειρότερα, ο Δρ Μακόι φέρεται αλλόκοτα. Ο πατέρας του Σποκ επισκέπτεται τον πλοίαρχο Κερκ και του λέει πως ο γιατρός φέρει το πνεύμα του γιου του. Ο Κερκ ζητάει άδεια να επιστρέψει στην Γένεσης και να διασώσει τον Σποκ, αφού είναι σίγουρος πως έχει επιβιώσει.
Ο νέος κυβερνήτης του Εντερπράιζ και το πλήρωμά του βρίσκονται αντιμέτωποι με έναν σατανικό επιστήμονα που καταστρέφει ολόκληρους γαλαξίες. Ο μόνος που μπορεί να τους βοηθήσει... θεωρείται νεκρός εδώ και εβδομήντα οκτώ χρόνια.
Ένα άγνωστο νεφέλωμα κατευθύνεται προς τη Γη, καταστρέφοντας τα πάντα στο πέρασμά του. Ο κάπτεν Κερκ και το πλήρωμα του Εντερπράιζ αναλαμβάνουν να ερευνήσουν εάν πίσω από το συγκεκριμένο φαινόμενο κρύβεται κάποια οντότητα, και να αποκαταστήσουν την τάξη στο Γαλαξία.
Το πλήρωμα του Εντερπράιζ θα επαναστατήσει ενάντια στην ίδια την Ομοσπονδία, όταν ο Πικάρ αποφασίζει να βοηθήσει την ειρηνική φυλή του Ba'ku εναντίον των Son'a. Οι μεν κατοικούν σε έναν πλανήτη που χαρίζει τη μακροζωία και τη σοφία. Οι δε θέλουν να τον κατακτήσουν και να εκμεταλλευτούν τις ευεργετικές του ιδιότητες.
Η αποστολή του Έντερπράϊζ για την αποκατάσταση της τάξης, μετά την εξέγερση στη Διαγαλαξιακή Ομοσπονδία, φαίνεται ότι βαίνει καλώς. Η προσοχή τώρα στρέφεται προς τον πλανήτη Ρόμουλους όπου και βρίσκεται το κέντρο των μεγάλων αποφάσεων. Οι κάτοικοι του εκφράζουν διάθεση θετική για διαπραγματεύσεις που θα μπορούσαν να οδηγήσουν στην ειρήνη. Επειγόντως ο πλοίαρχος Πικάρντ και το πλήρωμα του Εντερπράιζ ταξιδεύουν στον πλανήτη Ρόμουλους, όπου τους περιμένει μια μεγάλη έκπληξη.
Αρράκις, ο πλανήτης των ερήμων. Ένας κόσμος μυστηριώδης, άγονος, αφιλόξενος. Ο Αρράκις, γνωστός και ως Ντιουν είναι το μοναδικό μέρος σε ολόκληρο το γνωστό σύμπαν όπου υπάρχουν φυσικά αποθέματα του μπαχαρικού μελάνζ, της πολυτιμότερης ουσίας στην Αυτοκρατορία. Το μελάνζ παρατείνει τη ζωή, διευρύνει την ανθρώπινη συνείδηση κι επιτρέπει στους Πλοηγούς της Διαστημικής Συντεχνίας να αναδιπλώνουν το διάστημα, προσφέροντας έτσι στην ανθρωπότητα τη δυνατότητα να ταξιδεύει στα αστέρια.
Το πλήρωμα του Εντερπράιζ είναι σε άδεια όταν στον πλανήτη Νίμπους ΙΙΙ ένας Vulcan, ο Σάιμποκ κρατάει αιχμάλωτους τους πρεσβευτές των μεγάλων δυνάμεων. Ο Σάιμποκ και οι πιστοί ακόλουθοί του καταφέρνουν να πάρουν τη εξουσία του Εντερπράιζ, μέσα στο οποίο βρίσκονται ο Κάπτεν Κερκ, ο Σποκ και ο ΜακΚόι. Την ίδια στιγμή ένας Κλίνγκον κυνηγάει τον Κερκ, καθώς το σκάφος κατευθύνεται στο κέντρο του γαλαξία προς αναζήτηση της Πηγής της Ζωής…