Brian Cox i Emile Hirsch glume oca i sina, Tonyja i Austina, koji rade kao patolozi. Priča se odvija u mrtvačnici u koju im dostave tijelo nepoznate, lijepe mlade djevojke, koje je na neobjašnjiv način dospjelo na poprište višestrukog ubojstva. Bez ikakvih vidljivih tragova i dokaza koji bi mogli ukazati na razlog smrti, otac i sin odlučno kreću u potragu za bilo kakvim dokazima. Istraga ih dovede do bizarnih tragova koji ih navode na šokantno otkriće.
Nedaleko Londona, Don (Robert Carlyle) se sa svojom ženom Alice (Catherine McCormack) i nekolicinom preživjelih skriva na farmi. Kada ljudi zaraženi smrtonosnim virusom provale u kuću, Don se uspaniči te u bijegu zaboravi na suprugu koja ostane zarobljena u kući. Dvadeset i osam tjedana nakon pojave virusa koji je izbrisao gotovo čitavu populaciju Velike Britanije, London se čini siguran pa uz pomoć američke vojske preživjeli stanovnici polako naseljavaju grad. Tammy (Imogen Poots) i njen mlađi brat Andy vraćaju se iz Španjolske kako bi nastavili živjeti u Londonu zajedno s ocem Donom. Majka Alice im nedostaje pa se odluče vratiti na farmu kako bi uzeli stare slike i osobne stvari koje su morali ostaviti za sobom. Međutim, majku pronalaze živu.
Kada se izviđački brod Predatora sruši u Coloradu, Alieni koji su u njemu bili ukrcani pobjegnu i pobiju sve Predatore osim jednog. Posljednji preostali Predator sada mora uništiti sve Aliene kao i stravičnog Pred-Aliena začetog u prvom dijelu.