Járvány pusztította el a Föld népességének kilencvenkilenc százalékát 1997-ben. Majd negyven évvel később a túlélőkre is pusztulás vár a föld alatti világban. Csak akkor maradhatnak életben, ha sikerül információt szerezniük a gyilkos vírusról. James Cole-ra vár a feladat, hogy az időben visszautazva, megtudja azt. A számításba azonban hiba csúszik, Cole 1996 helyett 1990-be érkezik és elmegyógyintézetbe zárják. Így pedig aligha sikerül teljesíteni a küldetését és megfejteni a 12 Majom Hadseregének rejtélyét. Csupán a pszichológus Kathryn Railly próbálja megérteni a férfit.
Művészi és személyes válságának mélypontján Gustav von Aschenbach zeneszerző velencei utazása közben találkozik egy lengyel fiúval, Tadzióval. A fiú vélt tiszta ártatlansága annyira hat von Aschenbachra, hogy az önfeladásig rabja lesz a tökéletes szépségnek, és mindenüvé követi a fiút, hogy ne kelljen szenvednie közelségének hiányától. S végül ez lesz a végzete, Velencében ugyanis terjed a kolera. A zeneszerző a parton hal meg, utolsó pillantását a tengerből kiemelkedő fiúra vetve.
A középosztálybeli orvos, Walter és az elkényeztetett, felsőosztálybeli Kitty házassága elhibázott döntés volt. Kitty, férje munkája miatt, londoni életét hátrahagyva Sanghajba költözik, ahol rátalál a szerelem a helyi konzul személyében. Miután Walter felfedezi hűtlenségét, büntetésképpen a kolera által legsúlyosabban érintett területen fogad el egy állást, és ragaszkodik hozzá, hogy Kitty is vele tartson. Az utazás a gyönyörű távoli kínai faluba és az ott megélt szörnyűségek értelmet és célt adnak elveszettnek hitt kapcsolatuknak.
Jim felébred a kómából, de senkit sem talál a kórteremben. Üres a folyosó, az egész épület, üres és néma az egész város. Jim semmit sem ért, rémülten bóklászik a kihalt metropoliszban. Végül rátalál egy emberpár: túlélő, mindentől rettegő menekülők. És nemsokára találkoznak azokkal is, akik elől menekülni kell. Egykor emberek voltak, ám a gyilkos vírusnak köszönhetően már csak fékevesztett őrültek, akik ölni akarnak. Jim huszonnyolc napig feküdt a kórházban, de ez elég volt ahhoz, hogy Anglia szinte elnéptelenedjen.
1852, New Orleans. A csinos, ám önfejű July meggondolatlan kijelentéseivel és felelőtlen tetteivel visszariasztja vőlegényét a közelgő házasságuktól. A jegyesség felbontását később a lány százszor is megbánja, de egykori udvarlója már másnál vigasztalódik. Amikor a városban kitörő sárgalázjárványban egykori kedvese is megbetegszik, mindent elkövet, hogy ő maga ápolhassa a férfit. "Scarlett O'Hara kelt életre July személyében" - írta a New York Times kritikusa Bette Davis Oscar-díjas alakításáról.
Egyik államból a másikba történő autó szállítása közben, egy fiatalember egy ravasz és kiszámíthatatlan sorozatgyilkos hálójába kerül, aki sikeresen a férfire tereli a gyilkosságok gyanúját. Üldözi a rendőrség , s ráadásul a gyilkos árnyékként követi. A férfinek egyetlen segítsége akad, egy pincérnő személyében.
Doc Penny és kétfős bandája kirabol egy benzinkutat, de közben egyikük megsérül, egy rendőr pedig meghal. A sérült gengszter Steve Lacey-hez fut segítségért, akit még a börtönévekből ismer, de aki azóta jó útra tért, és feleségével él együtt. Lacey mindent megtesz, hogy kimaradjon a bajból, de miután a férfi meghal a lakásán, társai és a rendőrök is rászállnak.
Egy majom szervezetében halálos vírus kerül Afrikából az Egyesült Államokba. Még mielőtt a tudósok lokalizálni tudnák a vírushordozót, több száz ember fertőződik meg és óráról órára duplázódik az áldozatok száma. Ha nem sikerül megállítani a járványt, hetvenkét órán belül elpusztul Észak-Amerika egész lakossága.
Az AIDS felfedezésének története. A film a kezdetektől követi nyomon az eseményeket, mikor San Franciscóban sorra haltak meg a homoszexuális betegek valamilyen ismeretlen vírustól, és elvezet egészen a HIV vírus azonosításáig. A betegség terjedése talán mérsékelhető lett volna, ha a politikusok nem vonakodnak annyira beszélni róla..
Az Orvos és a Felesége két hétköznapi ember, aki a káosz középpontjában találja magát. A véletlennek köszönhetően az asszony immunis a különös járványra, amelynek hatására egy egész város lakossága megvakul. A hatóságok karantént rendelnek el. Annak ellenére, hogy az asszony lát, vakságot színlel, hogy ne szakítsák el a férjétől. A maga számára is meglepő módon az elhagyott szanatórium rettenetes világában valódi vezérré válik és arra ösztönzi az embereket, hogy tanuljanak meg a gyötrelmek és a bizonytalanság közepette életben maradni.
Az űrsikló rejtélyes lezuhanása ahhoz a félelmetes felfedezéshez vezet, hogy valami idegen van a roncsokban. Azok, akik kapcsolatba kerülnek vele, baljóslatú és különös módon megváltoznak. Hamarosan Carol és barátja, Ben megtudja a megdöbbentő igazságot a növekvő földönkívüli járványról.
A hadsereg karantén alá von egy kisvárost, amelynek közelében lezuhant egy kísérleti vegyi fegyvert szállító repülőgép. A kiszabadult vírus hatására az emberek megőrülnek és meghalnak. A katonák jéghideg precizitással próbálják megakadályozni a terjedését, miközben öt lakos próbál menekülni a környékről.
A film egy elképzelt párhuzamos világban játszódik, az 1960-as években, ahol a vérszívók az evolúció magasabb szintjét képviselik, és békében élnek az emberekkel. Ez a kényes egyensúly akkor borul fel, amikor végzetes influenza-járvány söpör végig a lakosságon, és néhány vámpír az emberek ellen fordul. A Testvériség Silus-t küldi, hogy fogja el a gyilkosokat az emberek rendõrségével együttműködve. Silus a vadászat során sötét titkot fedez fel a két faj jövõjérõl