Боевым пилотом робота серии «Еванглион» становится 14-летний Синдзи Икари — сын руководителя NERV Гэндо Икари, замкнутый и необщительный подросток, тяжело переживающий отдаление отца. Схожими проблемами страдают не только другие юные пилоты, но и взрослые сотрудники организации, от которых начальство скрывает истинный смысл проекта.

Старшеклассница Кёко — трудный подросток: она прогуливает занятия, состоит в банде байкеров и постоянно ссорится с родителями, которые её не понимают. Всё изменилось, когда она встретила учителя Кацую Хонду, который проявил интерес к её, на первый взгляд, буйному нраву. Однако суть в том, что только он видит, как на самом деле страдает девушка. Чуткое и заботливое отношение Кацуи помогло наконец Кёко принять ошибки прошлого и начать новую жизнь, обрести желанные счастье и любовь. Но жизнь бывает жестока, и кто знает, что может произойти в самые счастливые её моменты.