Kuolleet heräävät henkiin ja käyttävät ihmislihaa ravinnokseen. Paniikin aalto leviää ympäri maailmaa. Pieni joukko ihmisiä pakenee autioon taloon taistelemaan eloonjäämisestään. Elävien kuolleiden armeijan kasvaessa joukko huomaa että suurin uhka selviytymiselle saattaa löytyä omien joukosta...
Kauhu ja tuho, joka levisi elokuvassa 28 päivää myöhemmin jatkuu. Kuusi kuukautta sen jälkeen kun virus harvensi Lontoon asukasluvun olemattomiin. Järjestys on palautettu ja epidemia kukistettu. Yhdysvaltain armeija auttaa kotiuttamaan pakolaiset kotimaahansa ja asuttamaan saarivaltion uudelleen. Yksi siirtolaisista kantaa hirvittävää salaisuutta, joka uhkaa laukaista kuolemaa kylvävän, verenjanoisen epidemian uudelleen.
Umbrella Corporation on yksi maailman suurimmista biotekniikan ja lääkealan yrityksistä. Mutta syvällä maan alla, huippusalaisessa Pesäksi kutsutussa laboratoriossa tehdään kaikkien tuottavinta työtä, geenitutkimusta ja biologisia aseita. Mutta jotakin menee pahasti pieleen - tarttuva ja tappava virus pääsee laboratorion ulkopuolelle. Sen leviämistä yritetään estää lähetämällä kommandojoukot alas laboratorioon eristämään virus. Heillä on vain kolme tuntia aikaa. Perillä he huomaavat, että virus on jo ehtinyt muuttaa kaikki Pesään jääneet epäkuolleiksi. Suurin ongelma ei olekaan enää vain tikittävä kello, vaan vastassa olevat verenhimoiset zombiet ja Pesää vartioiva tekoäly - ja ne tekevät kaikkensa tappaakseen...
Paettuaan täpärästi maanalaisesta Pesästä Alice joutuu heti takaisin maan päällä raivoavan sodan syövereihin. Koska kaupunki on karanteenissa, Alice liittyy pieneen eliittisotilasjoukkoon, jota johtavat Valentine ja Carlos. Joukko on värvätty pelastamaan T-viruksen kehittäjän, tohtori Ashfordin kadonnut tytär. Tästä kehkeytyy epätoivoinen taistelu aikaa vastaan, kun joukko käy verenhimoisten zombien, viekkaiden lickereiden ja mutanttikoirien laumoja päin. Lisäksi he saavat vastaansa tähän saakka pahimman vihollisensa.
Joanna Mills alkaa nähdä yliluonnollisia näkyjä, joissa hänelle täysin tuntematon nainen murhataan brutaalisti. Painajaismaisten näkyjen ohjaamana Joanna päätyy texasilaiseen pikkukaupunkiin. Näkyjen edetessä Joannalle selviää, että on olemassa salaisuuksia, joita kukaan ei voi peitellä. Murha, jota hän yrittää kiihkeästi ratkaista, voi osoittautua hänen omakseen.
Pimeä puoli perustuu kauhun mestarin Stephen Kingin samannimiseen kirjaan. Se on vertahyytävä kertomus kirjailija Thad Beaumontista, joka kirjoittaa raakoja tarinoita nimimerkillä George Stark. Kirjat käyvät hyvin kaupaksi, kunnes joku pääsee selville Thadin kaksoisroolista. Välttyäkseen kiristykseltä, Thad päättää "haudata” Starkin ja jatkaa kirjoittamista omalla nimellään. Mutta paperille piirtyvät sanat eivät enää ole hänen omiaan ja kynää liikuttaa voima jota ei voi kahlita. Onko Stark noussut haudastaan vaatimaan hyvitystä?
Mikäpä pahan tappaisi. Sanoinkuvaamattoman kieroutunut Freddy Krueger nousee jälleen epäpyhästä haudastaan ja iskee kyntensä heihin, jotka yhä uskaltavat ummistaa silmänsä öisin. Mutta tällä kertaa Freddy kohtaa uuden, voimakkaan vastustajan! Ystäviensä joutuessa yksitellen Freddyn saaliiksi telepaattisia lahjoja omaava Kristen ottaa tehtäväkseen tuhota saatanallisen unien turmelijan. Kristen aikoo vapauttaa Freddyn uhrien kidutetut sielut lopullisesti.
Freddy ei kykene voittamaan unien valtiasta, joka päihitti kynsiniekan saagan neljännessä osassa. Freddy kääntää demonisen huomionsa vastustajansa syntymättömään lapseen ja vainoaa pienokaisen viattomia unia. Myös Kristenin lähipiiri saa tuta kauhun paljaan kosketuksen. Voidaanko lapsi pelastaa joutumasta Freddyn verisiin kynsiin? Vai jatkuuko pahuuden perintö uudessa sukupolvessa?