Kui liitlasvägede lennuk sakslaste poolt alla tulistatakse, suudavad nad end langevarjudega päästa. Kahjuks napib Pariisis sobivaid maandumisplatse ja nii avastab üks inglane end loomaaiast, teine langeb praktiliselt maalrile sülle ja kolmas maandub ooperimaja katusele. Nüüd peavad nad esmalt üksteist üles otsima ning siis leidma väljapääsu okupeeritud Prantsusmaalt. Seejuures saavad nad abi prantsuse tsiviilisikutelt.
Fionaga abielludes polnud Shrekil aimugi, et seetõttu peab ta ühel päeval võibolla kuningaks hakkama. Kui Shreki äiapapa, kuningas Harold korraga lahkub, ootab teda just see au. Välja arvatud juhul, kui Shrek (koos oma ustavate kaaslaste Eesli ja Saabastega Kassiga) leiaks enda asemele sobiva kuninga. Kõige lubavam kandidaat oleks Fiona nõbu Artie, keskkoolis õppiv ebakuninglik hädavares, kellest väärilise troonipärija kasvatamine näib olevat üks raskemaid ülesandeid, millega Shrek ja sõbrad eales silmitsi seisnud on.
Maailma kuulsaim mere-elanikust selgrootu, Käsna-Kalle Kantpüks, tuleb vee alt välja meie maailma seiklema. Härra Krabi ja Planktoni vahelise tüli käigus läheb kaduma salajane burgeri valmistamise retsept ning kui Bikini Põhja elanikud ei saa enam oma armastatud burksi süüa, võtab maad kohutav kaos. Kõik peavad retsepti varasteks Käsna-Kallet ja Planktonit. Kaasosalistest tandem ehitab olukorra päästmiseks ajamasina, millega siirdutakse aega enne retsepti salapärast kadumist. Teel satutakse aga kõikvõimalikesse teistesse kummalistesse paikadesse, kus kohatakse nii naljakaid kui ka nalja mitte mõistvaid olendeid. Kes on tegelikult burksiretsepti röövel ja mida kangelased Bikini Põhja rahu taastamiseks tegema peavad, see selgub kuival maal.