V roce 2024 byl ředitel Serano Genomics Ernest Serano unesen a propuštěn. Tuto událost zapříčinil hacker známý jako Vysmátý muž (The Laughing Man), jenž je nejnebezpečnějším hackerem v očích veřejnosti. O šest let později se Sekce 9 během vyšetřování tohoto hackera ocitá uprostřed spiknutí zkorumpovaných členů vlády. Vysmátý muž se se schopností nahackovat kybermozky a ovládat tak lidi vrátil a jeho motivy jsou převážně nejasné. Celá Sekce 9 tedy závodí s časem. Snaží se rozřešit původ Vysmátého muže a rozplést spiknutí velkých korporací, které hrají velkou roli v jeho plánech. Tento příběh je spojení všech důležitých událostí v případu okolo Vysmátého muže, které se odehrály v prvním seriálu GHOST IN THE SHELL: STAND ALONE COMPLEX
Pokračování seriálu Ghost in the Shell: Stand Alone Complex odehrávající se 2 roky po konci 2. série. Motoko Kusanagi mezitím opustila Sekci 9 a novým velitelem týmu se tak stal Togusa. Sekce 9 vyšetřuje sérii zdánlivě nesouvisejících incidentů, ale vyšetřování ukáže, že za vším nejspíš stojí jediný pachatel, hacker s přezdívkou "loutkář". Batou navíc odhalí, že i Motoko je do celého případu nějak zapletena. Mohla by právě ona být hledaný hacker?
V Japonsku roku 2029, v době, kdy každá část těla lze nahradit kyberimplantáty a většina lidí je neustále připojena k síti, vzniká speciální jednotka (sekce 6) určená ke stíhání hackerů. Když ovšem zatknou hackera, který si říká loutkař, zjistí, že to není člověk, ale pouze samoudržovací program zhotovený pro státní účely. Stojí tedy před otázkou, zda je tento program, který si vyvinul osobnost, bytost nebo ne. Ghost in the Shell 2.0 je pouze remake původního filmu z roku 1995. Je překreslený do moderní animace a jsou přidány realističtější zvuky.(Mello)
Píše se rok 2131. Z bitevní zóny v troskách města je vyzvednuta vojákyně Deunan a je převezena do uměle vytvořené metropole Olympus, ve které žijí Lidé s Bioroidy. Zde Deunan potkává svého dřívějšího spolubojovníka Briareose, který má cyborgové tělo (bioroid). Avšak v této tak dokonalé společnosti dochází ke konfliktu, mezi Lidmi a Bioroidy...
Píše se rok 2077. Uběhlo 10 let od doby, kdy se Japonsko rozhodlo opustit řady OSN. Celý ostrov je nyní obklopen ultramagnetickým polem, které brání vstupu do země. Špionážní služba USA náhle získává znepokojivou informaci, že Japonsko pracuje na ultimátní zbrani, jenž může představovat smrtelnou hrozbu pro celý svět. Je rozhodnuto vyslat k průzkumu zvláštní vojenskou jednotku SWORD, které velí dívka jménem VEXILLE a její milenec LEON. Členové SWORDu se vydávají za splněním úkolu na nebezpečnou misi do neznáma...
Deunan, mladá válečnice a Briareos, veterán kyborg-válečník, jsou oba partneři a milenci. Jakožto členové E.S.W.A.T. elitní speciální jednotky, která hlídá Olympus, jsou povoláni, když se objeví nějaký problém. Dva bojovníci najdou svůj vztah, který je testovaný novou cestou pomocí příjezdu nového člena do jejich řad. Tím je experimentální Bioroid Tereus.
Část města Los Angeles se roku 1999 stává válečnou zónou, kam se odváží jen gangy, ti, co nemají na vybranou a musí zde žít a pak ještě ti nejhorší z nejhorších. Uprostřed tohoto pekla se nachází škola, kam právě nastoupili noví učitelé. Nikdo ale netuší, že tito učitelé nejsou lidé, ale bývalí vojenští roboti, kteří byli upraveni a mají zde nastolit pořádek a disciplínu. Vše jde zpočátku dobře, ale po čase se experiment vymyká kontrole a roboti se opět vrací zpátky k vojenskému naprogramování, které má jednoduchý zákon - zabij, nebo budeš zabit!
Děsivá budoucnost nás zavede do temného podzemí, jemuž dominují kybernetické veřejné domy s mechanickými prostitutkami a nemilosrdní recyklátoři. Uplynulo několik let od chvíle, kdy společnost Pinwheel Robotics vytvořila nový druh Cyborga – ženy, která se svými schopnostmi téměř vyrovná lidem a krásou je jistě překoná. Nikdo netuší, že ve skutečnosti Cyborg jménem Cash vznikl jen proto, aby posloužil jako smrtící a zkázonosná zbraň. Po dramatických událostech je Cash schována do bezpečí „svobodné zóny“. Ale ne na dlouho. Biochemické problémy ničí její systém a návštěva lékaře na Sicílii potvrdí její nejčernější představy. Cash je víc než jen výtvor moderní kybernetické technologie. Je první svého druhu, která se má postarat o jeho rozšíření...
Záhadná oběť laboratorní exploze, Jobe, je zachráněn a teď touží po pomstě. Doktor Benjamin Trace se pokouší ubránit před zneužitím svůj objev virtuální reality za pomoci mladých hackerů. Unikátní čip se však dostane do rukou nepřítele, který usiluje o získání kontroly nad světem.