Il y a bien longtemps Môryô, un puissant démon, qui avait mené le monde au bord de la destruction, est aujourd'hui ramené à la vie par un être malfaisant. La nouvelle mission de Naruto est de protéger Shion, la prêtresse du Pays du Démon, menacée par Môryô. Elle est en effet la seule capable de sceller son âme maléfique. Elle a aussi un autre don : prédire le destin d'une personne sans jamais se tromper ! Sa dernière prédiction : Naruto va bientôt mourir'. Le seul moyen pour Naruto d'échapper à ce présage serait d'abandonner Shion au démon, mais ce n'est pas vraiment son style !

Lors du jour des âmes disparues , les ninjas se rendent au musée pour une exposition spéciale proposé par Dr Sanders. Il montre aux ninjas la salle des Vilains ou se trouve Cryptor, Kozu, Samukai, Chen, Morro et Pytor. Il explique aussi qu'il y aura une éclipse, l'une des plus rares et qu'il y aura de la magie dans l'air. Puis Cole vois le portrait de Sensei Yang qui l'appelle. Cole se rend au Temple de la Colline Hantée pour se venger de Senseï Yang de l'avoir transformé car il n'est plus visible par les vivants.

Ishikawa Goemon met la main sur un objet secret, ce qui provoque la colère du sanguinaire Toyotomi Hideyoshi. Sa tête mise à prix, le voleur virtuose va rapidement se retrouver au centre d'un écheveau de vengeances et de complots.

Raizo, jeune ninja orphelin, a été entraîné à tuer par le clan Ozunu. Peu après l'exécution de celle qu'il aime (elle a trahi le clan), Raizo est en proie au doute, et quitte alors le clan afin de préparer sa vengeance... Des années plus tard, à Berlin, Raizo tombe sur l'agent d'Europol Mika Coretti qui, après avoir levé le voile sur une affaire politique mettant en cause une mystérieuse organisation asiatique, est devenue la cible du clan Ozunu. Traqués, tous deux se lancent dans une dangereuse course-poursuite...

Un récit qui nous plonge en plein cœur d'un monde de ninjas que Kamui tente de fuir tant bien que mal, afin de retrouver un semblant de liberté. C'était sans compter sur le poids du destin qui le lie jusqu'à la mort à son clan. Kamui deviendra donc la cible d'incessantes attaques de ninjas entraînant dans son sillage mort et désolation…

Casey est le seul combattant américain ayant eu l’honneur d’intégrer la plus prestigieuse école d’arts martiaux japonaise, Lorsqu'un ancien disciple, Masayuki, qui est passé aux ordres de la terrible et mystérieuse organisation du Temple attaque l’établissement et massacre la plupart des étudiants, le Maître est contraint de demander à Casey d’accompagner sa fille Namiko à New York, C’est là qu’ils pourront mettre en sécurité l’armure sacrée de Yoroi Bitsu, une arme ancestrale aux pouvoirs illimités. Casey et Namiko vont devoir défendre l’artefact face à une armée d’assassins et de gangs sanguinaires tous aux ordres de Masayuki.

A la fin des vacances scolaires, Rintaro et ses amis de l'académie ninja acceptent de retrouver un sabre sacré afin de ne pas avoir de devoirs supplémentaires à faire...

Le soldat Joe Armstrong et le sergent Curtis Jackson débarquent sur l'île de Saint Thomas, dans les Caraïbes. Ils ont pour mission Top Secrète d'enquêter sur plusieurs disparitions mystérieuses de soldats américains... Très rapidement, Joe Armstrong et Curtis Jackson découvrent l'existence d'une base secrète où les militaires disparus sont reconditionnés pour devenir de redoutables guerriers Ninjas. Spécialement entrainés ils sèment la mort partout sur leur passage !

Sean Davidson et Carl Brackston sont envoyés pour libérer un commando d'élite de la Delta Force prisonnier d'une bande de ninjas. Ils sont également chargés d'y détruire un dispositif nucléaire. Hélas, ils sont eux aussi faits prisonniers. Le gouvernement américain envoie alors Joe Armstrong, un ninja, ancien membre de la CIA.

Ancien champion de karaté, Scott James n'est pas homme à courber l'échine. Au meurtre de Justine, une riche et belle héritière qui lui demande de la protéger, il réagit par une colère noire, froide. Scott James ne poursuit désormais plus qu'un but : infiltrer Ninja, une organisation terroriste internationale dirigée par Seikura, qui fut autrefois son frère d'armes…

Deux frères surfeurs découvrent qu'ils sont les deux princes perdus d'une île chinoise. Une partie de leur héritage consiste dans la maitrise des arts martiaux. Ils décident de s'en servir pour vaincre le dictateur ayant pris le contrôle de leur île.

Pour obtenir l'exclusivité mondiale du puissant insecticide mis au point par le professeur Strobel, un magnat de la chimie enlève la fille du scientifique, avec la complicité de mercenaires ninjas. Joe, un Américain ceinture noire, flanqué d'un jeune ninja de 12 ans, part affronter le terrible gang...

Jackson est de retour, et il a maintenant un nouveau partenaire, champion de karaté : Sean. Ils doivent faire face à une organisation terroriste connue sous le nom «Le Cobra», et qui a infecté Sean avec un virus. Sean et Jackson n'ont pas d'autre choix que lutter contre le Cobra et sa bande de ninjas.

Quelques temps ont passé depuis que Kojirô a vaincu les forces du mal représentées par Chaos. A présent, c'est à l'intérieur de son propre camp qu'une nouvelle menace se prépare. En effet, certains membres du clan Fûma ont décidé de se rebeller contre l'ordre établi. Shôryû a réussi à démasquer l'un d'entre eux, Raien, et en le piégeant il réussit à trouver les autres renégats. Accompagné de Ryûhô et Kirikaze, il se débarrasse des félons à l'exception de Raien qui parvient à s'enfuir.

Encadré pour assassinant le Grand Maître, le Lost Ninja clan doit se battre contre leur chemin un bunker nucléaire souterrain rempli de hordes d'ennemis surnaturels, des mutants et des zombies manger de la chair. Piégé 200 pieds au-dessous de la croûte terrestre, ces ninjas feront face à l'enfer.