אליס כבר לא סובלת משכחה - היא זוכרת הכול והסיוט עדיין לא עבר. בעבר היא ניסתה להימלט עם קבוצת לוחמים ממתקן סודי תת-קרקעי של חברת אמברלה, עכשיו היא נמצאת על פני הקרקע בעיר ראקון שנשלטת על ידי החברה. כרגע השולטים הם המתים שמהלכים ברחובות ולא נותנים צ'אנס לבני אנוש רגילים. אליס רוצה להימלט מהעיר אך הבעיה היחידה היא שהזומבים עברו אבולוציה ועכשיו הם הרבה יותר חכמים וקשה לחסל אותם.

סוכן 47, נולד כדי להיות רוצח. הקוד הגנטי שלו הונדס משילוב של רוצחים קטלניים, הוא חונך על ידי טובי המתנקשים בחסות פלג מסתורי של הכנסייה הקתולית והפך לכוח קטלני שמטרתו היא לחסל פושעים. הוא מבריק וכריזמטי ושיטת הפעולה שלו פשוטה ונקיה. הוא מקבל מידע על המטרה שלו, נכנס בשקט, מחסל ועוזב את המקום מבלי להותיר אחריו סימן או זכר. סימני ההיכר שלו הם דיוק בלתי מתפשר, כבוד וגאוה מקצועית, אבל אפילו הוא אינו מצליח לקחת בחשבון את המהפך העומד להתרחש בחייו? התעוררות מצפונו והרגשות המתפתחים בקרבו כלפי אחת מקורבנותיו. אישה יפה ומסתורית, שמתגלה כהרבה פחות מתוקה ועדינה משחשב. מה שמתחיל כמשימת חיסול נוספת מתגלה כמלכודת ושערורייה פוליטית עולמית, הגורמת לסוכן 47 לברוח בכל רחבי אירופה מהצבא הרוסי והאינטרפול.