SG-1 komanda, viena iš daugelio, bet pati svarbiausia galaktikoje. Dabar jos svarbiausias tikslas - sunaikinti atvykstančius kariauti Boalo karius. Vieną dieną komanda pasigenda dviejų narių. Pulkininkas leitenantas Mičelas ir archeologas daktaras Danielius supranta, kad buvo sugadintas pagrindinis įrenginys, leidžiantis keliauti laiku ir erdve. Komanda skuba į Žemę. Deja, atsiduria tokiame pasaulyje, kuriame Žvaigždžių vartų - senovinio prietaiso, perkeliančio į tolimiausias planetas, nėra buvę. O ir jie patys bei jų istorija lieka lyg nebuvę. Taigi komandai tenka įtikinėti abejonių kupiną valdžią ir armiją, kad laiką persuko galingas ateivis, siekdamas užkariauti Žemę. O laikas bėga nenumaldomai...

Filmas prasideda ten, kur baigiasi ŽVAIGŽDŽIŲ VARTAI – 1 su puikia ŽVAIGŽDŽIŲ VARTŲ komanda: Danieliu Jacksonu Michael Shanks, Vala Claudia Black, Teal’c Christopher Judge, Sem Amanda Tapping ir Kem Ben Browder. Būrys pakyla į savo įspūdingiausią gyvenimo nuotykį. Beieškant istorinio ginklo, kuriuo tikisi įveikti despotiškąjį Orį. Komanda sužino, kad tuo metu Ori jau pasirengęs atakuoti Žemę!